RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCBE1-202ENST00000439986 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.93□□□□□ -0.02
CCBE1-202ENST00000439986 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.92□□□□□ -0.02
CCBE1-202ENST00000439986 NPHP1O15259 732 aa14.92□□□□□ -0.02
CCBE1-202ENST00000439986 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCBE1-202ENST00000439986 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCBE1-202ENST00000439986 CUX2O14529 1486 aa14.9□□□□□ -0.02
CCBE1-202ENST00000439986 PLCB2Q00722 1185 aa14.9□□□□□ -0.02
CCBE1-202ENST00000439986 BECN1Q14457 450 aa14.9□□□□□ -0.02
CCBE1-202ENST00000439986 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 NEFHP12036 1026 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 CLSTN1O94985 981 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 RGS3P49796 1198 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 CASC1Q6TDU7 716 aa14.83□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.83□□□□□ -0.03
CCBE1-202ENST00000439986 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 FOXD1Q16676 465 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 SOX12O15370 315 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.79□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.79□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 CFAP53Q96M91 514 aa14.78□□□□□ -0.04
CCBE1-202ENST00000439986 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 NUDCQ9Y266 331 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 FGD1P98174 961 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 CDCA8Q53HL2 280 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 FMN1Q68DA7 1419 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 POGKQ9P215 609 aa14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 GOLGA2Q08379 1002 aa14.71□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 KCNJ4P48050 445 aa14.71□□□□□ -0.05
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.69□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 SMARCA2P51531 1590 aa14.69□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 WWC1Q8IX03 1113 aa14.69□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 PKD2Q13563 968 aa14.69□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.68□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 SMARCA4P51532 1647 aa14.68□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 MLECQ14165 292 aa14.68□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 TMF1P82094 1093 aa14.66□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 APBB1O00213 710 aa14.65□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 RALBP1Q15311 655 aa14.65□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 KIF21BO75037 1637 aa14.65□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.65□□□□□ -0.06
CCBE1-202ENST00000439986 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.61□□□□□ -0.07
CCBE1-202ENST00000439986 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCBE1-202ENST00000439986 DRC7Q8IY82 874 aa14.6□□□□□ -0.07
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCBE1-202ENST00000439986 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-202ENST00000439986 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-202ENST00000439986 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-202ENST00000439986 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 NLRP13Q86W25 1043 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 PDE4AP27815 886 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 PDE3BQ13370 1112 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 RAD21O60216 631 aa14.55□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 STK26Q9P289 416 aa14.55□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 NUP155O75694 1391 aa14.55□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.55□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 HSCBQ8IWL3 235 aa14.54□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCBE1-202ENST00000439986 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.54□□□□□ -0.08
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