RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF14Q15058 1648 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-201ENST00000429755 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATP10AO60312 1499 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MADDQ8WXG6 1647 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AFAP1Q8N556 730 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KDM5CP41229 1560 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PREX2Q70Z35 1606 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MLECQ14165 292 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-201ENST00000429755 REREQ9P2R6 1566 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCC1P33527 1531 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AGLP35573 1532 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FBXO41Q8TF61 875 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCA6Q8N139 1617 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HSPA2P54652 639 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CEP162Q5TB80 1403 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATP7AQ04656 1500 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-201ENST00000429755 A2MP01023 1474 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MBD5Q9P267 1494 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NPATQ14207 1427 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TIAM1Q13009 1591 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C3P01024 1663 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZMYM3Q14202 1370 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLXNC1O60486 1568 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MROH2AA6NES4 1674 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NCOA2Q15596 1464 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CERKQ8TCT0 537 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTPRTO14522 1441 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAP3K1Q13233 1512 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GGT6Q6P531 493 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.45■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 STRCQ7RTU9 1775 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TSPY4P0CV99 314 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TSPY10P0CW01 314 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTPRKQ15262 1439 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NCOA1Q15788 1441 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF3BO15066 747 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MIA2Q96PC5 1412 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PKD2Q13563 968 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLA2R1Q13018 1463 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-201ENST00000429755 APLP2Q06481 763 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms