RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 DOK7Q18PE1 504 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRK-211ENST00000429595 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRK-211ENST00000429595 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-211ENST00000429595 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-211ENST00000429595 RIMBP2O15034 1052 aa15.43■□□□□ 0.06
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.21■□□□□ 0.03
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRK-211ENST00000429595 SLC34A2O95436 690 aa15.18■□□□□ 0.02
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PTPRK-211ENST00000429595 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-211ENST00000429595 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.89□□□□□ -0.03
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PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.86□□□□□ -0.03
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PTPRK-211ENST00000429595 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
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PTPRK-211ENST00000429595 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-211ENST00000429595 MFSD10Q14728 455 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-211ENST00000429595 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-211ENST00000429595 HRO43593 1189 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-211ENST00000429595 KCNK17Q96T54 332 aa14.67□□□□□ -0.06
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PTPRK-211ENST00000429595 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.62□□□□□ -0.07
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PTPRK-211ENST00000429595 KCNH8Q96L42 1107 aa14.55□□□□□ -0.08
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PTPRK-211ENST00000429595 CAMK2BQ13554 666 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-211ENST00000429595 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-211ENST00000429595 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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PTPRK-211ENST00000429595 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
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PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-211ENST00000429595 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
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PTPRK-211ENST00000429595 STAC3Q96MF2 364 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRK-211ENST00000429595 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRK-211ENST00000429595 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRK-211ENST00000429595 PHF14O94880 888 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRK-211ENST00000429595 COL9A1P20849 921 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRK-211ENST00000429595 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRK-211ENST00000429595 FBXW7Q969H0 707 aa14.35□□□□□ -0.11
PTPRK-211ENST00000429595 PROX2Q3B8N5 592 aa14.34□□□□□ -0.11
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