RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429260.6

C9orf116-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf116, Length 678 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-205ENST00000429260 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
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C9orf116-205ENST00000429260 NCOA2Q15596 1464 aa23.3■■□□□ 1.32
C9orf116-205ENST00000429260 NEO1Q92859 1461 aa23.3■■□□□ 1.32
C9orf116-205ENST00000429260 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.29■■□□□ 1.32
C9orf116-205ENST00000429260 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.29■■□□□ 1.32
C9orf116-205ENST00000429260 KCNA4P22459 653 aa23.29■■□□□ 1.32
C9orf116-205ENST00000429260 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
C9orf116-205ENST00000429260 AKNAQ7Z591 1439 aa23.27■■□□□ 1.32
C9orf116-205ENST00000429260 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.27■■□□□ 1.32
C9orf116-205ENST00000429260 KDM6BO15054 1643 aa23.26■■□□□ 1.31
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C9orf116-205ENST00000429260 PREX2Q70Z35 1606 aa23.26■■□□□ 1.31
C9orf116-205ENST00000429260 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.25■■□□□ 1.31
C9orf116-205ENST00000429260 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
C9orf116-205ENST00000429260 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf116-205ENST00000429260 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.23■■□□□ 1.31
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C9orf116-205ENST00000429260 ADGRL1O94910 1474 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf116-205ENST00000429260 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.18■■□□□ 1.3
C9orf116-205ENST00000429260 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
C9orf116-205ENST00000429260 RAPGEF3O95398 923 aa23.17■■□□□ 1.3
C9orf116-205ENST00000429260 MSH5O43196 834 aa23.15■■□□□ 1.3
C9orf116-205ENST00000429260 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.15■■□□□ 1.3
C9orf116-205ENST00000429260 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.11■■□□□ 1.29
C9orf116-205ENST00000429260 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
C9orf116-205ENST00000429260 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.11■■□□□ 1.29
C9orf116-205ENST00000429260 MIA2Q96PC5 1412 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf116-205ENST00000429260 ABCC1P33527 1531 aa23.1■■□□□ 1.29
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C9orf116-205ENST00000429260 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf116-205ENST00000429260 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf116-205ENST00000429260 AFAP1Q8N556 730 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 RICTORQ6R327 1708 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.04■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.04■■□□□ 1.28
C9orf116-205ENST00000429260 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf116-205ENST00000429260 MBD5Q9P267 1494 aa22.99■■□□□ 1.27
C9orf116-205ENST00000429260 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.99■■□□□ 1.27
C9orf116-205ENST00000429260 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.98■■□□□ 1.27
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C9orf116-205ENST00000429260 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
C9orf116-205ENST00000429260 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.97■■□□□ 1.27
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C9orf116-205ENST00000429260 TSPY10P0CW01 314 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf116-205ENST00000429260 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf116-205ENST00000429260 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf116-205ENST00000429260 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf116-205ENST00000429260 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf116-205ENST00000429260 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.89■■□□□ 1.26
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C9orf116-205ENST00000429260 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 ATP7AQ04656 1500 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 ABCC5O15440 1437 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 DAPK1P53355 1430 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
C9orf116-205ENST00000429260 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf116-205ENST00000429260 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf116-205ENST00000429260 ABCA6Q8N139 1617 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf116-205ENST00000429260 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.8■■□□□ 1.24
C9orf116-205ENST00000429260 ITGAEP38570 1179 aa22.79■■□□□ 1.24
C9orf116-205ENST00000429260 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.79■■□□□ 1.24
C9orf116-205ENST00000429260 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.79■■□□□ 1.24
C9orf116-205ENST00000429260 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf116-205ENST00000429260 A2MP01023 1474 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf116-205ENST00000429260 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
C9orf116-205ENST00000429260 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf116-205ENST00000429260 REREQ9P2R6 1566 aa22.73■■□□□ 1.23
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C9orf116-205ENST00000429260 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.73■■□□□ 1.23
C9orf116-205ENST00000429260 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
C9orf116-205ENST00000429260 MLECQ14165 292 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf116-205ENST00000429260 PTPRKQ15262 1439 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-205ENST00000429260 PLXNC1O60486 1568 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-205ENST00000429260 KIF15Q9NS87 1388 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf116-205ENST00000429260 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf116-205ENST00000429260 AGLP35573 1532 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf116-205ENST00000429260 NCOA1Q15788 1441 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf116-205ENST00000429260 ADGRL2O95490 1459 aa22.67■■□□□ 1.22
C9orf116-205ENST00000429260 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
C9orf116-205ENST00000429260 KIF3BO15066 747 aa22.65■■□□□ 1.22
C9orf116-205ENST00000429260 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.65■■□□□ 1.22
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