RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
TTLL3-210ENST00000427220 IFT140Q96RY7 1462 aa27.39■■□□□ 1.98
TTLL3-210ENST00000427220 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.39■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.38■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 PKD2Q13563 968 aa27.37■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC184Q52MB2 194 aa27.37■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 ADAMTS12P58397 1594 aa27.36■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 KDM6BO15054 1643 aa27.36■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 PBRM1Q86U86 1689 aa27.36■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 HECW1Q76N89 1606 aa27.34■■□□□ 1.97
TTLL3-210ENST00000427220 GRIN2AQ12879 1464 aa27.32■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.31■■□□□ 1.96
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TTLL3-210ENST00000427220 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 DISP1Q96F81 1524 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 TSPY4P0CV99 314 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 TSPY10P0CW01 314 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC5O15440 1437 aa27.27■■□□□ 1.96
TTLL3-210ENST00000427220 DAPK1P53355 1430 aa27.26■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 MRS2Q9HD23 443 aa27.26■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 WDR62O43379 1518 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 CCER2I3L3R5 266 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL3-210ENST00000427220 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 NUP155O75694 1391 aa27.18■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 MIA2Q96PC5 1412 aa27.17■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.14■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA0556O60303 1618 aa27.14■■□□□ 1.94
TTLL3-210ENST00000427220 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.11■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.11■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF11O15085 1522 aa27.09■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.08■■□□□ 1.93
TTLL3-210ENST00000427220 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.08■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 SYNJ2O15056 1496 aa27.07■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.06■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRGP23470 1445 aa27.06■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.05■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.05■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 CEP170Q5SW79 1584 aa27.05■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC7Q96M83 1385 aa27.02■■□□□ 1.92
TTLL3-210ENST00000427220 NCOA1Q15788 1441 aa27.01■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 KIF14Q15058 1648 aa27■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 AKNAQ7Z591 1439 aa26.98■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.97■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.95■■□□□ 1.91
TTLL3-210ENST00000427220 ATP10BO94823 1461 aa26.94■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 ROCK1Q13464 1354 aa26.93■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 KIF15Q9NS87 1388 aa26.92■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 USP47Q96K76 1375 aa26.92■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TTLL3-210ENST00000427220 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.88■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.88■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 TMC1Q8TDI8 760 aa26.86■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 PZPP20742 1482 aa26.86■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.85■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.84■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.84■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.83■■□□□ 1.89
TTLL3-210ENST00000427220 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TTLL3-210ENST00000427220 NUP160Q12769 1436 aa26.8■■□□□ 1.88
TTLL3-210ENST00000427220 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TTLL3-210ENST00000427220 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.77■■□□□ 1.88
TTLL3-210ENST00000427220 AFAP1Q8N556 730 aa26.76■■□□□ 1.87
TTLL3-210ENST00000427220 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TTLL3-210ENST00000427220 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TTLL3-210ENST00000427220 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.66■■□□□ 1.86
TTLL3-210ENST00000427220 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.62■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.61■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.6■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.6■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.59■■□□□ 1.85
TTLL3-210ENST00000427220 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.57■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 ABCA8O94911 1581 aa26.55■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.55■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.55■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 KIF3BO15066 747 aa26.54■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.54■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.52■■□□□ 1.84
TTLL3-210ENST00000427220 PANK3Q9H999 370 aa26.51■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 MBD5Q9P267 1494 aa26.5■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.49■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.49■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 ADGRL2O95490 1459 aa26.49■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.48■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.45■■□□□ 1.83
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