RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.67□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.65□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CABP2Q9NPB3 220 aa8.64□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.64□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DOK7Q18PE1 504 aa8.63□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.63□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMARCA2P51531 1590 aa8.62□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EEA1Q15075 1411 aa8.61□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 G3V3G9 751 aa8.6□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KLHL34Q8N239 644 aa8.59□□□□□ -1.03
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.57□□□□□ -1.04
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.57□□□□□ -1.04
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.57□□□□□ -1.04
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.56□□□□□ -1.04
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RIMBP2O15034 1052 aa8.54□□□□□ -1.04
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HRCP23327 699 aa8.54□□□□□ -1.04
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NCAPD3P42695 1498 aa8.53□□□□□ -1.04
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPR153Q6NV75 609 aa8.52□□□□□ -1.05
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HMGXB3Q12766 1538 aa8.52□□□□□ -1.05
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.51□□□□□ -1.05
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.5□□□□□ -1.05
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MICALL2Q8IY33 904 aa8.49□□□□□ -1.05
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTGER2P43116 358 aa8.48□□□□□ -1.05
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.47□□□□□ -1.05
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.46□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.46□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARSIQ5FYB1 569 aa8.44□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.42□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ABCC8Q09428 1581 aa8.41□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPOCK2Q92563 424 aa8.4□□□□□ -1.06
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.39□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CFTRP13569 1480 aa8.38□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GOLGA3Q08378 1498 aa8.38□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SOGA1O94964 1423 aa8.37□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF21BO75037 1637 aa8.37□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TOP2BQ02880 1626 aa8.37□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.37□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.36□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CEP162Q5TB80 1403 aa8.36□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SYNJ1O43426 1573 aa8.35□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.34□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.34□□□□□ -1.07
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SOX12O15370 315 aa8.32□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.32□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.32□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PBX2P40425 430 aa8.3□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUDT7P0C024 238 aa8.29□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.29□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRXQ9BXM0 1461 aa8.29□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HCSTQ9UBK5 93 aa8.28□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.28□□□□□ -1.08
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LHX6Q9UPM6 363 aa8.27□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF27Q86VH2 1401 aa8.27□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF3CO14782 793 aa8.25□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRDM2Q13029 1718 aa8.25□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CUX1P39880 1505 aa8.24□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CLIP1P30622 1438 aa8.24□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.24□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.23□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.23□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C2orf72A6NCS6 295 aa8.22□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.21□□□□□ -1.09
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.21□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.18□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NLRP6P59044 892 aa8.18□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARHGAP33O14559 1287 aa8.17□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HRO43593 1189 aa8.17□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC34A2O95436 690 aa8.17□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGF1RP08069 1367 aa8.17□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.16□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.15□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP3K1Q13233 1512 aa8.15□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PKD2Q13563 968 aa8.15□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MFRPQ9BY79 579 aa8.15□□□□□ -1.1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.14□□□□□ -1.11
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.13□□□□□ -1.11
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.13□□□□□ -1.11
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TK2O00142 265 aa8.13□□□□□ -1.11
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PSEN2P49810 448 aa8.13□□□□□ -1.11
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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