RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 PREX2Q70Z35 1606 aa28.43■■■□□ 2.14
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SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.09■■■□□ 2.09
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SEMA3B-201ENST00000416295 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.05■■■□□ 2.08
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SEMA3B-201ENST00000416295 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
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SEMA3B-201ENST00000416295 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.93■■■□□ 2.06
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SEMA3B-201ENST00000416295 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.92■■■□□ 2.06
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SEMA3B-201ENST00000416295 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.89■■■□□ 2.05
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SEMA3B-201ENST00000416295 TSPY10P0CW01 314 aa27.87■■■□□ 2.05
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SEMA3B-201ENST00000416295 A2MP01023 1474 aa27.83■■■□□ 2.05
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SEMA3B-201ENST00000416295 PLXNC1O60486 1568 aa27.81■■■□□ 2.04
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SEMA3B-201ENST00000416295 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.76■■■□□ 2.03
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SEMA3B-201ENST00000416295 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.72■■■□□ 2.03
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SEMA3B-201ENST00000416295 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.62■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.62■■■□□ 2.01
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SEMA3B-201ENST00000416295 GGT6Q6P531 493 aa27.61■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.6■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.57■■■□□ 2
SEMA3B-201ENST00000416295 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.57■■■□□ 2
SEMA3B-201ENST00000416295 ADGRL2O95490 1459 aa27.57■■■□□ 2
SEMA3B-201ENST00000416295 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
SEMA3B-201ENST00000416295 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.56■■■□□ 2
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