RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413952.6

SUMF2-206, Transcript of sulfatase modifying factor 2, human

TSL 3

Gene SUMF2, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMF2-206	ENST00000413952	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SUMF2-206	ENST00000413952	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SUMF2-206	ENST00000413952	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SUMF2-206	ENST00000413952	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SUMF2-206	ENST00000413952	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SUMF2-206	ENST00000413952	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SUMF2-206	ENST00000413952	HSPA2	P54652	639 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SUMF2-206	ENST00000413952	MLEC	Q14165	292 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SUMF2-206	ENST00000413952	KIF14	Q15058	1648 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SUMF2-206	ENST00000413952	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SUMF2-206	ENST00000413952	ATP10A	O60312	1499 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SUMF2-206	ENST00000413952	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SUMF2-206	ENST00000413952	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SUMF2-206	ENST00000413952	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SUMF2-206	ENST00000413952	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
SUMF2-206	ENST00000413952	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SUMF2-206	ENST00000413952	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SUMF2-206	ENST00000413952	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SUMF2-206	ENST00000413952	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SUMF2-206	ENST00000413952	KDM5C	P41229	1560 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SUMF2-206	ENST00000413952	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SUMF2-206	ENST00000413952	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SUMF2-206	ENST00000413952	CLIP1	P30622	1438 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SUMF2-206	ENST00000413952	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SUMF2-206	ENST00000413952	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SUMF2-206	ENST00000413952	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SUMF2-206	ENST00000413952	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SUMF2-206	ENST00000413952	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SUMF2-206	ENST00000413952	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	ABCC1	P33527	1531 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SUMF2-206	ENST00000413952	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SUMF2-206	ENST00000413952	C3	P01024	1663 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SUMF2-206	ENST00000413952	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SUMF2-206	ENST00000413952	AGL	P35573	1532 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SUMF2-206	ENST00000413952	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SUMF2-206	ENST00000413952	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SUMF2-206	ENST00000413952	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SUMF2-206	ENST00000413952	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SUMF2-206	ENST00000413952	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SUMF2-206	ENST00000413952	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
SUMF2-206	ENST00000413952	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SUMF2-206	ENST00000413952	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SUMF2-206	ENST00000413952	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SUMF2-206	ENST00000413952	PTPRT	O14522	1441 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SUMF2-206	ENST00000413952	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SUMF2-206	ENST00000413952	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.17	■■■□□ 2.74
SUMF2-206	ENST00000413952	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SUMF2-206	ENST00000413952	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
SUMF2-206	ENST00000413952	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SUMF2-206	ENST00000413952	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SUMF2-206	ENST00000413952	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SUMF2-206	ENST00000413952	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SUMF2-206	ENST00000413952	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SUMF2-206	ENST00000413952	NPAT	Q14207	1427 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SUMF2-206	ENST00000413952	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SUMF2-206	ENST00000413952	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SUMF2-206	ENST00000413952	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
SUMF2-206	ENST00000413952	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
SUMF2-206	ENST00000413952	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SUMF2-206	ENST00000413952	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SUMF2-206	ENST00000413952	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SUMF2-206	ENST00000413952	A2M	P01023	1474 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SUMF2-206	ENST00000413952	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SUMF2-206	ENST00000413952	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SUMF2-206	ENST00000413952	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SUMF2-206	ENST00000413952	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
SUMF2-206	ENST00000413952	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
SUMF2-206	ENST00000413952	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SUMF2-206	ENST00000413952	GGT6	Q6P531	493 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SUMF2-206	ENST00000413952	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.95	■■■□□ 2.7
SUMF2-206	ENST00000413952	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SUMF2-206	ENST00000413952	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SUMF2-206	ENST00000413952	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SUMF2-206	ENST00000413952	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SUMF2-206	ENST00000413952	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SUMF2-206	ENST00000413952	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SUMF2-206	ENST00000413952	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SUMF2-206	ENST00000413952	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SUMF2-206	ENST00000413952	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SUMF2-206	ENST00000413952	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SUMF2-206	ENST00000413952	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SUMF2-206	ENST00000413952	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SUMF2-206	ENST00000413952	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SUMF2-206	ENST00000413952	PKD2	Q13563	968 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SUMF2-206	ENST00000413952	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SUMF2-206	ENST00000413952	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SUMF2-206	ENST00000413952	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SUMF2-206	ENST00000413952	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SUMF2-206	ENST00000413952	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SUMF2-206	ENST00000413952	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SUMF2-206	ENST00000413952	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.72	■■■□□ 2.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms