RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407684.1

GAREM2-202, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GAREM2, Length 5,138 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-202ENST00000407684 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.45■■□□□ 1.34
GAREM2-202ENST00000407684 NUP155O75694 1391 aa23.44■■□□□ 1.34
GAREM2-202ENST00000407684 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GAREM2-202ENST00000407684 PKD2Q13563 968 aa23.44■■□□□ 1.34
GAREM2-202ENST00000407684 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.44■■□□□ 1.34
GAREM2-202ENST00000407684 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GAREM2-202ENST00000407684 SLC24A1O60721 1099 aa23.4■■□□□ 1.34
GAREM2-202ENST00000407684 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GAREM2-202ENST00000407684 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 MAP3K1Q13233 1512 aa23.38■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 ADAMTS12P58397 1594 aa23.38■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 UACAQ9BZF9 1416 aa23.36■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 GGT6Q6P531 493 aa23.33■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 MIA2Q96PC5 1412 aa23.33■■□□□ 1.33
GAREM2-202ENST00000407684 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 KIF3BO15066 747 aa23.31■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 FOXD1Q16676 465 aa23.31■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.3■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.3■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 WDR97A6NE52 1622 aa23.3■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.28■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 TMC1Q8TDI8 760 aa23.27■■□□□ 1.32
GAREM2-202ENST00000407684 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.26■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.26■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 MRS2Q9HD23 443 aa23.25■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.24■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 PBRM1Q86U86 1689 aa23.22■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 MLECQ14165 292 aa23.21■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
GAREM2-202ENST00000407684 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.2■■□□□ 1.3
GAREM2-202ENST00000407684 CDCA8Q53HL2 280 aa23.19■■□□□ 1.3
GAREM2-202ENST00000407684 KIF15Q9NS87 1388 aa23.19■■□□□ 1.3
GAREM2-202ENST00000407684 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.19■■□□□ 1.3
GAREM2-202ENST00000407684 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.18■■□□□ 1.3
GAREM2-202ENST00000407684 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GAREM2-202ENST00000407684 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.16■■□□□ 1.3
GAREM2-202ENST00000407684 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.14■■□□□ 1.3
GAREM2-202ENST00000407684 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.13■■□□□ 1.29
GAREM2-202ENST00000407684 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.13■■□□□ 1.29
GAREM2-202ENST00000407684 NUP160Q12769 1436 aa23.12■■□□□ 1.29
GAREM2-202ENST00000407684 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
GAREM2-202ENST00000407684 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.1■■□□□ 1.29
GAREM2-202ENST00000407684 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GAREM2-202ENST00000407684 KIAA0556O60303 1618 aa23.09■■□□□ 1.29
GAREM2-202ENST00000407684 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.07■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 HFM1A2PYH4 1435 aa23.06■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 KIF14Q15058 1648 aa23.06■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.06■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.05■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 DAPK1P53355 1430 aa23.05■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 AFAP1Q8N556 730 aa23.04■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 ARHGEF11O15085 1522 aa23.03■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 NBR1Q14596 966 aa23.02■■□□□ 1.28
GAREM2-202ENST00000407684 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GAREM2-202ENST00000407684 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GAREM2-202ENST00000407684 TMF1P82094 1093 aa22.99■■□□□ 1.27
GAREM2-202ENST00000407684 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.99■■□□□ 1.27
GAREM2-202ENST00000407684 ROCK1Q13464 1354 aa22.98■■□□□ 1.27
GAREM2-202ENST00000407684 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
GAREM2-202ENST00000407684 POGKQ9P215 609 aa22.97■■□□□ 1.27
GAREM2-202ENST00000407684 ATP10BO94823 1461 aa22.95■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.95■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 DISP1Q96F81 1524 aa22.95■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.95■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.92■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.91■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 SAMD9Q5K651 1589 aa22.91■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 NAIPQ13075 1403 aa22.9■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 CEP170Q5SW79 1584 aa22.9■■□□□ 1.26
GAREM2-202ENST00000407684 ABCC5O15440 1437 aa22.88■■□□□ 1.25
GAREM2-202ENST00000407684 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.87■■□□□ 1.25
GAREM2-202ENST00000407684 CD109Q6YHK3 1445 aa22.87■■□□□ 1.25
GAREM2-202ENST00000407684 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
GAREM2-202ENST00000407684 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GAREM2-202ENST00000407684 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GAREM2-202ENST00000407684 C14orf37Q86TY3 774 aa22.83■■□□□ 1.25
GAREM2-202ENST00000407684 AKNAQ7Z591 1439 aa22.83■■□□□ 1.25
GAREM2-202ENST00000407684 STAC3Q96MF2 364 aa22.81■■□□□ 1.24
GAREM2-202ENST00000407684 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.79■■□□□ 1.24
GAREM2-202ENST00000407684 ARXQ96QS3 562 aa22.78■■□□□ 1.24
GAREM2-202ENST00000407684 ADGRL1O94910 1474 aa22.77■■□□□ 1.24
GAREM2-202ENST00000407684 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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