RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400376.2

TTYH3-202, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TTYH3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-202ENST00000400376 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.03■■■□□ 2.08
TTYH3-202ENST00000400376 AFAP1Q8N556 730 aa28.02■■■□□ 2.08
TTYH3-202ENST00000400376 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TTYH3-202ENST00000400376 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.01■■■□□ 2.07
TTYH3-202ENST00000400376 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
TTYH3-202ENST00000400376 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
TTYH3-202ENST00000400376 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28■■■□□ 2.07
TTYH3-202ENST00000400376 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.98■■■□□ 2.07
TTYH3-202ENST00000400376 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.97■■■□□ 2.07
TTYH3-202ENST00000400376 TIAM1Q13009 1591 aa27.97■■■□□ 2.07
TTYH3-202ENST00000400376 APLP2Q06481 763 aa27.95■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 MAP3K1Q13233 1512 aa27.94■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.94■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.93■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.92■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 PREX2Q70Z35 1606 aa27.92■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 RICTORQ6R327 1708 aa27.91■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 NCOA2Q15596 1464 aa27.9■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.9■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.9■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.9■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TTYH3-202ENST00000400376 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.88■■■□□ 2.05
TTYH3-202ENST00000400376 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.88■■■□□ 2.05
TTYH3-202ENST00000400376 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.87■■■□□ 2.05
TTYH3-202ENST00000400376 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
TTYH3-202ENST00000400376 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.86■■■□□ 2.05
TTYH3-202ENST00000400376 ABCC1P33527 1531 aa27.84■■■□□ 2.05
TTYH3-202ENST00000400376 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.84■■■□□ 2.05
TTYH3-202ENST00000400376 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.82■■■□□ 2.04
TTYH3-202ENST00000400376 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.81■■■□□ 2.04
TTYH3-202ENST00000400376 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.8■■■□□ 2.04
TTYH3-202ENST00000400376 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TTYH3-202ENST00000400376 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.78■■■□□ 2.04
TTYH3-202ENST00000400376 ATP10AO60312 1499 aa27.78■■■□□ 2.04
TTYH3-202ENST00000400376 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.78■■■□□ 2.04
TTYH3-202ENST00000400376 KDM5CP41229 1560 aa27.77■■■□□ 2.04
TTYH3-202ENST00000400376 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TTYH3-202ENST00000400376 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.75■■■□□ 2.03
TTYH3-202ENST00000400376 MBD5Q9P267 1494 aa27.72■■■□□ 2.03
TTYH3-202ENST00000400376 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.71■■■□□ 2.03
TTYH3-202ENST00000400376 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.7■■■□□ 2.03
TTYH3-202ENST00000400376 MLECQ14165 292 aa27.7■■■□□ 2.02
TTYH3-202ENST00000400376 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.7■■■□□ 2.02
TTYH3-202ENST00000400376 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.67■■■□□ 2.02
TTYH3-202ENST00000400376 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.66■■■□□ 2.02
TTYH3-202ENST00000400376 MIA2Q96PC5 1412 aa27.65■■■□□ 2.02
TTYH3-202ENST00000400376 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.64■■■□□ 2.02
TTYH3-202ENST00000400376 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.62■■■□□ 2.01
TTYH3-202ENST00000400376 TSPY4P0CV99 314 aa27.6■■■□□ 2.01
TTYH3-202ENST00000400376 TSPY10P0CW01 314 aa27.6■■■□□ 2.01
TTYH3-202ENST00000400376 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.59■■■□□ 2.01
TTYH3-202ENST00000400376 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.59■■■□□ 2.01
TTYH3-202ENST00000400376 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.58■■■□□ 2.01
TTYH3-202ENST00000400376 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.58■■■□□ 2.01
TTYH3-202ENST00000400376 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.58■■■□□ 2
TTYH3-202ENST00000400376 ABCA6Q8N139 1617 aa27.57■■■□□ 2
TTYH3-202ENST00000400376 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.57■■■□□ 2
TTYH3-202ENST00000400376 PTPRMP28827 1452 aa27.55■■■□□ 2
TTYH3-202ENST00000400376 ATP7AQ04656 1500 aa27.55■■■□□ 2
TTYH3-202ENST00000400376 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
TTYH3-202ENST00000400376 REREQ9P2R6 1566 aa27.54■■■□□ 2
TTYH3-202ENST00000400376 AGLP35573 1532 aa27.51■■■□□ 2
TTYH3-202ENST00000400376 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.5■■□□□ 1.99
TTYH3-202ENST00000400376 A2MP01023 1474 aa27.5■■□□□ 1.99
TTYH3-202ENST00000400376 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.49■■□□□ 1.99
TTYH3-202ENST00000400376 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TTYH3-202ENST00000400376 MADDQ8WXG6 1647 aa27.49■■□□□ 1.99
TTYH3-202ENST00000400376 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
TTYH3-202ENST00000400376 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.47■■□□□ 1.99
TTYH3-202ENST00000400376 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
TTYH3-202ENST00000400376 GGT6Q6P531 493 aa27.43■■□□□ 1.98
TTYH3-202ENST00000400376 ABCC5O15440 1437 aa27.42■■□□□ 1.98
TTYH3-202ENST00000400376 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
TTYH3-202ENST00000400376 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
TTYH3-202ENST00000400376 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TTYH3-202ENST00000400376 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.41■■□□□ 1.98
TTYH3-202ENST00000400376 KIF3BO15066 747 aa27.38■■□□□ 1.97
TTYH3-202ENST00000400376 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TTYH3-202ENST00000400376 PLXNC1O60486 1568 aa27.37■■□□□ 1.97
TTYH3-202ENST00000400376 DAPK1P53355 1430 aa27.35■■□□□ 1.97
TTYH3-202ENST00000400376 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.35■■□□□ 1.97
TTYH3-202ENST00000400376 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.35■■□□□ 1.97
TTYH3-202ENST00000400376 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.34■■□□□ 1.97
TTYH3-202ENST00000400376 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.33■■□□□ 1.97
TTYH3-202ENST00000400376 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.31■■□□□ 1.96
TTYH3-202ENST00000400376 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.3■■□□□ 1.96
TTYH3-202ENST00000400376 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.29■■□□□ 1.96
TTYH3-202ENST00000400376 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.28■■□□□ 1.96
TTYH3-202ENST00000400376 ZMYM3Q14202 1370 aa27.28■■□□□ 1.96
TTYH3-202ENST00000400376 KIF15Q9NS87 1388 aa27.26■■□□□ 1.95
TTYH3-202ENST00000400376 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
TTYH3-202ENST00000400376 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.23■■□□□ 1.95
TTYH3-202ENST00000400376 NCOA1Q15788 1441 aa27.22■■□□□ 1.95
TTYH3-202ENST00000400376 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.21■■□□□ 1.95
TTYH3-202ENST00000400376 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.2■■□□□ 1.94
TTYH3-202ENST00000400376 PTPRKQ15262 1439 aa27.19■■□□□ 1.94
TTYH3-202ENST00000400376 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
TTYH3-202ENST00000400376 ITGAEP38570 1179 aa27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms