RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390604.2

IGHV3-16-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional), humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-16, Length 425 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16-201ENST00000390604 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
IGHV3-16-201ENST00000390604 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
IGHV3-16-201ENST00000390604 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.56■■□□□ 1.52
IGHV3-16-201ENST00000390604 RICTORQ6R327 1708 aa24.55■■□□□ 1.52
IGHV3-16-201ENST00000390604 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.55■■□□□ 1.52
IGHV3-16-201ENST00000390604 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.51■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.5■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 CERKQ8TCT0 537 aa24.5■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.5■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.5■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.49■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.49■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.47■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.46■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.46■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 PLCH2O75038 1416 aa24.45■■□□□ 1.51
IGHV3-16-201ENST00000390604 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
IGHV3-16-201ENST00000390604 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.44■■□□□ 1.5
IGHV3-16-201ENST00000390604 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
IGHV3-16-201ENST00000390604 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.39■■□□□ 1.49
IGHV3-16-201ENST00000390604 ATP10AO60312 1499 aa24.38■■□□□ 1.49
IGHV3-16-201ENST00000390604 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.35■■□□□ 1.49
IGHV3-16-201ENST00000390604 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.35■■□□□ 1.49
IGHV3-16-201ENST00000390604 AFAP1Q8N556 730 aa24.34■■□□□ 1.49
IGHV3-16-201ENST00000390604 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.33■■□□□ 1.49
IGHV3-16-201ENST00000390604 KIF14Q15058 1648 aa24.32■■□□□ 1.48
IGHV3-16-201ENST00000390604 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.31■■□□□ 1.48
IGHV3-16-201ENST00000390604 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.29■■□□□ 1.48
IGHV3-16-201ENST00000390604 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-16-201ENST00000390604 APLP2Q06481 763 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-16-201ENST00000390604 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-16-201ENST00000390604 ILDR2Q71H61 639 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-16-201ENST00000390604 TIAM1Q13009 1591 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-16-201ENST00000390604 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-16-201ENST00000390604 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-16-201ENST00000390604 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-16-201ENST00000390604 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-16-201ENST00000390604 MAP3K1Q13233 1512 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-16-201ENST00000390604 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-16-201ENST00000390604 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-16-201ENST00000390604 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-16-201ENST00000390604 KDM5CP41229 1560 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-16-201ENST00000390604 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-16-201ENST00000390604 STRCQ7RTU9 1775 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-16-201ENST00000390604 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-16-201ENST00000390604 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 NCOA2Q15596 1464 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 PREX2Q70Z35 1606 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 PTPRTO14522 1441 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 SOCS7O14512 581 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-16-201ENST00000390604 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.07■■□□□ 1.44
IGHV3-16-201ENST00000390604 ABCA6Q8N139 1617 aa24.07■■□□□ 1.44
IGHV3-16-201ENST00000390604 REREQ9P2R6 1566 aa24.07■■□□□ 1.44
IGHV3-16-201ENST00000390604 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
IGHV3-16-201ENST00000390604 AGLP35573 1532 aa24.05■■□□□ 1.44
IGHV3-16-201ENST00000390604 C3P01024 1663 aa24.03■■□□□ 1.44
IGHV3-16-201ENST00000390604 ABCC1P33527 1531 aa24.02■■□□□ 1.44
IGHV3-16-201ENST00000390604 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24■■□□□ 1.43
IGHV3-16-201ENST00000390604 NCOA1Q15788 1441 aa24■■□□□ 1.43
IGHV3-16-201ENST00000390604 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
IGHV3-16-201ENST00000390604 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
IGHV3-16-201ENST00000390604 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.98■■□□□ 1.43
IGHV3-16-201ENST00000390604 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.96■■□□□ 1.43
IGHV3-16-201ENST00000390604 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.95■■□□□ 1.43
IGHV3-16-201ENST00000390604 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.95■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 ZMYM3Q14202 1370 aa23.95■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.95■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.91■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 NPATQ14207 1427 aa23.91■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.91■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.9■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.9■■□□□ 1.42
IGHV3-16-201ENST00000390604 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.88■■□□□ 1.41
IGHV3-16-201ENST00000390604 MIA2Q96PC5 1412 aa23.87■■□□□ 1.41
IGHV3-16-201ENST00000390604 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.86■■□□□ 1.41
IGHV3-16-201ENST00000390604 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.86■■□□□ 1.41
IGHV3-16-201ENST00000390604 MBD5Q9P267 1494 aa23.86■■□□□ 1.41
IGHV3-16-201ENST00000390604 GGT6Q6P531 493 aa23.85■■□□□ 1.41
IGHV3-16-201ENST00000390604 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.84■■□□□ 1.41
IGHV3-16-201ENST00000390604 PKD2Q13563 968 aa23.83■■□□□ 1.41
IGHV3-16-201ENST00000390604 PTPRKQ15262 1439 aa23.8■■□□□ 1.4
IGHV3-16-201ENST00000390604 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.79■■□□□ 1.4
IGHV3-16-201ENST00000390604 A2MP01023 1474 aa23.79■■□□□ 1.4
IGHV3-16-201ENST00000390604 MROH2AA6NES4 1674 aa23.78■■□□□ 1.4
IGHV3-16-201ENST00000390604 ATP7AQ04656 1500 aa23.78■■□□□ 1.4
IGHV3-16-201ENST00000390604 TSPY4P0CV99 314 aa23.77■■□□□ 1.4
IGHV3-16-201ENST00000390604 TSPY10P0CW01 314 aa23.77■■□□□ 1.4
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