RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1-202ENST00000380828 FBLN2P98095 1184 aa9.38□□□□□ -0.91
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RABGEF1-202ENST00000380828 SHROOM2Q13796 1616 aa9.38□□□□□ -0.91
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RABGEF1-202ENST00000380828 CEP170Q5SW79 1584 aa9.18□□□□□ -0.94
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RABGEF1-202ENST00000380828 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
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RABGEF1-202ENST00000380828 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-202ENST00000380828 GPATCH11Q8N954 259 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-202ENST00000380828 FKBP8Q14318 412 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-202ENST00000380828 PTMSP20962 102 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC27Q2M243 656 aa9.05□□□□□ -0.96
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