RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372870.5

SLC27A4-202, Transcript of solute carrier family 27 member 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC27A4, Length 1,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4-202ENST00000372870 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.84■■■□□ 2.53
SLC27A4-202ENST00000372870 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.83■■■□□ 2.53
SLC27A4-202ENST00000372870 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.79■■■□□ 2.52
SLC27A4-202ENST00000372870 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.79■■■□□ 2.52
SLC27A4-202ENST00000372870 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.79■■■□□ 2.52
SLC27A4-202ENST00000372870 KIF14Q15058 1648 aa30.78■■■□□ 2.52
SLC27A4-202ENST00000372870 MLECQ14165 292 aa30.76■■■□□ 2.52
SLC27A4-202ENST00000372870 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
SLC27A4-202ENST00000372870 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.74■■■□□ 2.51
SLC27A4-202ENST00000372870 FBXO41Q8TF61 875 aa30.74■■■□□ 2.51
SLC27A4-202ENST00000372870 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.71■■■□□ 2.51
SLC27A4-202ENST00000372870 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.71■■■□□ 2.51
SLC27A4-202ENST00000372870 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
SLC27A4-202ENST00000372870 HSPA2P54652 639 aa30.7■■■□□ 2.5
SLC27A4-202ENST00000372870 ATP10AO60312 1499 aa30.68■■■□□ 2.5
SLC27A4-202ENST00000372870 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.67■■■□□ 2.5
SLC27A4-202ENST00000372870 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.67■■■□□ 2.5
SLC27A4-202ENST00000372870 CLIP1P30622 1438 aa30.65■■■□□ 2.5
SLC27A4-202ENST00000372870 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.64■■■□□ 2.5
SLC27A4-202ENST00000372870 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.63■■■□□ 2.49
SLC27A4-202ENST00000372870 AFAP1Q8N556 730 aa30.61■■■□□ 2.49
SLC27A4-202ENST00000372870 KDM5CP41229 1560 aa30.6■■■□□ 2.49
SLC27A4-202ENST00000372870 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.58■■■□□ 2.49
SLC27A4-202ENST00000372870 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.54■■■□□ 2.48
SLC27A4-202ENST00000372870 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.53■■■□□ 2.48
SLC27A4-202ENST00000372870 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.53■■■□□ 2.48
SLC27A4-202ENST00000372870 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
SLC27A4-202ENST00000372870 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.52■■■□□ 2.48
SLC27A4-202ENST00000372870 PREX2Q70Z35 1606 aa30.51■■■□□ 2.48
SLC27A4-202ENST00000372870 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.48■■■□□ 2.47
SLC27A4-202ENST00000372870 ABCA6Q8N139 1617 aa30.48■■■□□ 2.47
SLC27A4-202ENST00000372870 ABCC1P33527 1531 aa30.47■■■□□ 2.47
SLC27A4-202ENST00000372870 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.46■■■□□ 2.47
SLC27A4-202ENST00000372870 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.46■■■□□ 2.47
SLC27A4-202ENST00000372870 REREQ9P2R6 1566 aa30.45■■■□□ 2.47
SLC27A4-202ENST00000372870 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.43■■■□□ 2.46
SLC27A4-202ENST00000372870 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.41■■■□□ 2.46
SLC27A4-202ENST00000372870 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.4■■■□□ 2.46
SLC27A4-202ENST00000372870 CERKQ8TCT0 537 aa30.36■■■□□ 2.45
SLC27A4-202ENST00000372870 AGLP35573 1532 aa30.36■■■□□ 2.45
SLC27A4-202ENST00000372870 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.35■■■□□ 2.45
SLC27A4-202ENST00000372870 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.35■■■□□ 2.45
SLC27A4-202ENST00000372870 C3P01024 1663 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC27A4-202ENST00000372870 STRCQ7RTU9 1775 aa30.31■■■□□ 2.44
SLC27A4-202ENST00000372870 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
SLC27A4-202ENST00000372870 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.3■■■□□ 2.44
SLC27A4-202ENST00000372870 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
SLC27A4-202ENST00000372870 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
SLC27A4-202ENST00000372870 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.27■■■□□ 2.44
SLC27A4-202ENST00000372870 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
SLC27A4-202ENST00000372870 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.23■■■□□ 2.43
SLC27A4-202ENST00000372870 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
SLC27A4-202ENST00000372870 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
SLC27A4-202ENST00000372870 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.19■■■□□ 2.42
SLC27A4-202ENST00000372870 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
SLC27A4-202ENST00000372870 ATP7AQ04656 1500 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC27A4-202ENST00000372870 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
SLC27A4-202ENST00000372870 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC27A4-202ENST00000372870 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.14■■■□□ 2.42
SLC27A4-202ENST00000372870 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
SLC27A4-202ENST00000372870 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.12■■■□□ 2.41
SLC27A4-202ENST00000372870 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.12■■■□□ 2.41
SLC27A4-202ENST00000372870 MROH2AA6NES4 1674 aa30.11■■■□□ 2.41
SLC27A4-202ENST00000372870 PTPRTO14522 1441 aa30.11■■■□□ 2.41
SLC27A4-202ENST00000372870 PLXNC1O60486 1568 aa30.09■■■□□ 2.41
SLC27A4-202ENST00000372870 ZMYM3Q14202 1370 aa30.09■■■□□ 2.41
SLC27A4-202ENST00000372870 A2MP01023 1474 aa30.07■■■□□ 2.4
SLC27A4-202ENST00000372870 NPATQ14207 1427 aa30.07■■■□□ 2.4
SLC27A4-202ENST00000372870 NCOA1Q15788 1441 aa30.07■■■□□ 2.4
SLC27A4-202ENST00000372870 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SLC27A4-202ENST00000372870 TIAM1Q13009 1591 aa30.04■■■□□ 2.4
SLC27A4-202ENST00000372870 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SLC27A4-202ENST00000372870 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC27A4-202ENST00000372870 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.01■■■□□ 2.39
SLC27A4-202ENST00000372870 GGT6Q6P531 493 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC27A4-202ENST00000372870 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC27A4-202ENST00000372870 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.97■■■□□ 2.39
SLC27A4-202ENST00000372870 MBD5Q9P267 1494 aa29.96■■■□□ 2.39
SLC27A4-202ENST00000372870 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.95■■■□□ 2.39
SLC27A4-202ENST00000372870 CEP162Q5TB80 1403 aa29.94■■■□□ 2.38
SLC27A4-202ENST00000372870 PTPRKQ15262 1439 aa29.94■■■□□ 2.38
SLC27A4-202ENST00000372870 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SLC27A4-202ENST00000372870 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.91■■■□□ 2.38
SLC27A4-202ENST00000372870 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
SLC27A4-202ENST00000372870 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.88■■■□□ 2.37
SLC27A4-202ENST00000372870 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC27A4-202ENST00000372870 PLA2R1Q13018 1463 aa29.85■■■□□ 2.37
SLC27A4-202ENST00000372870 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.85■■■□□ 2.37
SLC27A4-202ENST00000372870 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SLC27A4-202ENST00000372870 NCOA2Q15596 1464 aa29.84■■■□□ 2.37
SLC27A4-202ENST00000372870 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SLC27A4-202ENST00000372870 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.82■■■□□ 2.36
SLC27A4-202ENST00000372870 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
SLC27A4-202ENST00000372870 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.82■■■□□ 2.36
SLC27A4-202ENST00000372870 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.82■■■□□ 2.36
SLC27A4-202ENST00000372870 PKD2Q13563 968 aa29.8■■■□□ 2.36
SLC27A4-202ENST00000372870 KIF3BO15066 747 aa29.77■■■□□ 2.36
SLC27A4-202ENST00000372870 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC27A4-202ENST00000372870 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SLC27A4-202ENST00000372870 ILDR2Q71H61 639 aa29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms