RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372071.6

OPN4-202, Transcript of opsin 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN4, Length 2,401 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4-202ENST00000372071 FOXD1Q16676 465 aa21.29■■□□□ 1
OPN4-202ENST00000372071 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.29■■□□□ 1
OPN4-202ENST00000372071 ABCA8O94911 1581 aa21.29■■□□□ 1
OPN4-202ENST00000372071 ATP10BO94823 1461 aa21.28■■□□□ 1
OPN4-202ENST00000372071 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.28■■□□□ 1
OPN4-202ENST00000372071 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
OPN4-202ENST00000372071 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
OPN4-202ENST00000372071 PTPRGP23470 1445 aa21.26■□□□□ 0.99
OPN4-202ENST00000372071 AKNAQ7Z591 1439 aa21.26■□□□□ 0.99
OPN4-202ENST00000372071 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
OPN4-202ENST00000372071 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.25■□□□□ 0.99
OPN4-202ENST00000372071 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.25■□□□□ 0.99
OPN4-202ENST00000372071 ROCK1Q13464 1354 aa21.2■□□□□ 0.98
OPN4-202ENST00000372071 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.2■□□□□ 0.98
OPN4-202ENST00000372071 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
OPN4-202ENST00000372071 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.17■□□□□ 0.98
OPN4-202ENST00000372071 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.17■□□□□ 0.98
OPN4-202ENST00000372071 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.17■□□□□ 0.98
OPN4-202ENST00000372071 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.15■□□□□ 0.98
OPN4-202ENST00000372071 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.13■□□□□ 0.97
OPN4-202ENST00000372071 NCOA1Q15788 1441 aa21.12■□□□□ 0.97
OPN4-202ENST00000372071 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.12■□□□□ 0.97
OPN4-202ENST00000372071 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
OPN4-202ENST00000372071 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
OPN4-202ENST00000372071 SHROOM2Q13796 1616 aa21.08■□□□□ 0.97
OPN4-202ENST00000372071 KCNH8Q96L42 1107 aa21.08■□□□□ 0.97
OPN4-202ENST00000372071 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.07■□□□□ 0.96
OPN4-202ENST00000372071 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.05■□□□□ 0.96
OPN4-202ENST00000372071 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.04■□□□□ 0.96
OPN4-202ENST00000372071 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.04■□□□□ 0.96
OPN4-202ENST00000372071 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.03■□□□□ 0.96
OPN4-202ENST00000372071 PZPP20742 1482 aa21.02■□□□□ 0.96
OPN4-202ENST00000372071 ADGRL2O95490 1459 aa21.02■□□□□ 0.96
OPN4-202ENST00000372071 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.01■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 TSPY4P0CV99 314 aa21■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 TSPY10P0CW01 314 aa21■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 PKD2Q13563 968 aa20.97■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 ABCC2Q92887 1545 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.96■□□□□ 0.95
OPN4-202ENST00000372071 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 MBD5Q9P267 1494 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.95■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 NUP155O75694 1391 aa20.93■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 KIF15Q9NS87 1388 aa20.93■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.92■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 PREX2Q70Z35 1606 aa20.92■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.91■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.91■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.9■□□□□ 0.94
OPN4-202ENST00000372071 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.88■□□□□ 0.93
OPN4-202ENST00000372071 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.88■□□□□ 0.93
OPN4-202ENST00000372071 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
OPN4-202ENST00000372071 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.87■□□□□ 0.93
OPN4-202ENST00000372071 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.86■□□□□ 0.93
OPN4-202ENST00000372071 ANP32CO43423 234 aa20.85■□□□□ 0.93
OPN4-202ENST00000372071 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
OPN4-202ENST00000372071 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
OPN4-202ENST00000372071 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
OPN4-202ENST00000372071 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.8■□□□□ 0.92
OPN4-202ENST00000372071 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.79■□□□□ 0.92
OPN4-202ENST00000372071 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
OPN4-202ENST00000372071 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.79■□□□□ 0.92
OPN4-202ENST00000372071 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.78■□□□□ 0.92
OPN4-202ENST00000372071 PLCH2O75038 1416 aa20.76■□□□□ 0.91
OPN4-202ENST00000372071 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.74■□□□□ 0.91
OPN4-202ENST00000372071 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.74■□□□□ 0.91
OPN4-202ENST00000372071 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.74■□□□□ 0.91
OPN4-202ENST00000372071 CCER2I3L3R5 266 aa20.72■□□□□ 0.91
OPN4-202ENST00000372071 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.71■□□□□ 0.91
OPN4-202ENST00000372071 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.71■□□□□ 0.91
OPN4-202ENST00000372071 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.7■□□□□ 0.9
OPN4-202ENST00000372071 CCDC7Q96M83 1385 aa20.7■□□□□ 0.9
OPN4-202ENST00000372071 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.69■□□□□ 0.9
OPN4-202ENST00000372071 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.69■□□□□ 0.9
OPN4-202ENST00000372071 AFAP1Q8N556 730 aa20.68■□□□□ 0.9
OPN4-202ENST00000372071 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.67■□□□□ 0.9
OPN4-202ENST00000372071 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.66■□□□□ 0.9
OPN4-202ENST00000372071 ABCC1P33527 1531 aa20.64■□□□□ 0.9
OPN4-202ENST00000372071 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.64■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.64■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 RGL3Q3MIN7 710 aa20.64■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 USP47Q96K76 1375 aa20.63■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.63■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 PLXNC1O60486 1568 aa20.62■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 OSCARQ8IYS5 282 aa20.62■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 UNC13BO14795 1591 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 PLA2R1Q13018 1463 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 CCDC184Q52MB2 194 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN4-202ENST00000372071 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms