RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.25□□□□□ -1.09
TMLHE-202ENST00000369439 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.24□□□□□ -1.09
TMLHE-202ENST00000369439 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.24□□□□□ -1.09
TMLHE-202ENST00000369439 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TMLHE-202ENST00000369439 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TMLHE-202ENST00000369439 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.23□□□□□ -1.09
TMLHE-202ENST00000369439 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.22□□□□□ -1.09
TMLHE-202ENST00000369439 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.22□□□□□ -1.09
TMLHE-202ENST00000369439 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.22□□□□□ -1.09
TMLHE-202ENST00000369439 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.21□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 KIF21BO75037 1637 aa8.21□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 P3H3Q8IVL6 736 aa8.19□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 CD109Q6YHK3 1445 aa8.19□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.18□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.18□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 PITPNM1O00562 1244 aa8.17□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.16□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.16□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 ABCA8O94911 1581 aa8.15□□□□□ -1.1
TMLHE-202ENST00000369439 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.14□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 GOLGA3Q08378 1498 aa8.13□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 RAPGEF3O95398 923 aa8.12□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.12□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.11□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 PTPRMP28827 1452 aa8.11□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 MADDQ8WXG6 1647 aa8.1□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 ATP10BO94823 1461 aa8.09□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 FBXO41Q8TF61 875 aa8.09□□□□□ -1.11
TMLHE-202ENST00000369439 PRR29P0C7W0 189 aa8.08□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 HSPA2P54652 639 aa8.08□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.07□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 MLECQ14165 292 aa8.07□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.07□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.07□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.07□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 PRXQ9BXM0 1461 aa8.06□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.06□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.06□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.06□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.05□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.03□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 SAMD9Q5K651 1589 aa8.03□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TMLHE-202ENST00000369439 NEO1Q92859 1461 aa8.02□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.02□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.01□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.01□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 FANCAO15360 1455 aa8□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 TPRNQ4KMQ1 711 aa8□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 RICTORQ6R327 1708 aa8□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.99□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 PLEKHG5O94827 1062 aa7.99□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 AKNAQ7Z591 1439 aa7.99□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 CREBZFQ9NS37 354 aa7.99□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.98□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.98□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.97□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 PKD2Q13563 968 aa7.97□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.97□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.97□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.97□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 HECW1Q76N89 1606 aa7.96□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 POGZQ7Z3K3 1410 aa7.96□□□□□ -1.13
TMLHE-202ENST00000369439 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 MIER1Q8N108 512 aa7.96□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.96□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 CERKQ8TCT0 537 aa7.95□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.95□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.95□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.94□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 CHADLQ6NUI6 762 aa7.92□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 ILDR2Q71H61 639 aa7.92□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 KIF14Q15058 1648 aa7.92□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.91□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.91□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 ARHGAP5Q13017 1502 aa7.91□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 MYO5CQ9NQX4 1742 aa7.9□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.9□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.9□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
TMLHE-202ENST00000369439 ATP10AO60312 1499 aa7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms