RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.02■□□□□ 0.64
HCN3-201ENST00000368358 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.98■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 MIA2Q96PC5 1412 aa18.95■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 AFAP1Q8N556 730 aa18.95■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 NAIPQ13075 1403 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 PKD2Q13563 968 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 DAPK1P53355 1430 aa18.93■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 KIF14Q15058 1648 aa18.93■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.92■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 HFM1A2PYH4 1435 aa18.91■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 ABCC5O15440 1437 aa18.91■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 RGL3Q3MIN7 710 aa18.91■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 NUP155O75694 1391 aa18.91■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.9■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
HCN3-201ENST00000368358 ABCA8O94911 1581 aa18.86■□□□□ 0.61
HCN3-201ENST00000368358 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
HCN3-201ENST00000368358 KIF15Q9NS87 1388 aa18.85■□□□□ 0.61
HCN3-201ENST00000368358 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.82■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 ABCC2Q92887 1545 aa18.82■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.81■□□□□ 0.6
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HCN3-201ENST00000368358 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.8■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 KIF3BO15066 747 aa18.79■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.79■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 GGT6Q6P531 493 aa18.79■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.77■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.77■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 NCOA1Q15788 1441 aa18.76■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 ASXL2Q76L83 1435 aa18.75■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 MAPKBP1O60336 1514 aa18.74■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 RAPGEF3O95398 923 aa18.74■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.74■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 AKNAQ7Z591 1439 aa18.74■□□□□ 0.59
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HCN3-201ENST00000368358 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.71■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 MLECQ14165 292 aa18.7■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.7■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.7■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 ANP32CO43423 234 aa18.69■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 ROCK1Q13464 1354 aa18.69■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 KDM6BO15054 1643 aa18.68■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.68■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.67■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.67■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 SHROOM2Q13796 1616 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 PLCH2O75038 1416 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 CD109Q6YHK3 1445 aa18.64■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 FANCAO15360 1455 aa18.63■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.62■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 ADGRL1O94910 1474 aa18.6■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.6■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.58■□□□□ 0.57
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HCN3-201ENST00000368358 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.58■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.57■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.57■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 MBD5Q9P267 1494 aa18.56■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.55■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.55■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.55■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 KANK1Q14678 1352 aa18.54■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.54■□□□□ 0.56
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HCN3-201ENST00000368358 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.53■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.52■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.51■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.51■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 BCANQ96GW7 911 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 PREX2Q70Z35 1606 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 PZPP20742 1482 aa18.46■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.46■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.44■□□□□ 0.54
HCN3-201ENST00000368358 ADGRL2O95490 1459 aa18.43■□□□□ 0.54
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