RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.72□□□□□ -0.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.7□□□□□ -0.22
RNU1-38P-201ENST00000362817 G3V3G9 751 aa13.69□□□□□ -0.22
RNU1-38P-201ENST00000362817 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFRPQ9BY79 579 aa13.68□□□□□ -0.22
RNU1-38P-201ENST00000362817 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.66□□□□□ -0.22
RNU1-38P-201ENST00000362817 NESP48681 1621 aa13.65□□□□□ -0.22
RNU1-38P-201ENST00000362817 POTEJP0CG39 1038 aa13.65□□□□□ -0.22
RNU1-38P-201ENST00000362817 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.63□□□□□ -0.23
RNU1-38P-201ENST00000362817 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.62□□□□□ -0.23
RNU1-38P-201ENST00000362817 OTUD5Q96G74 571 aa13.62□□□□□ -0.23
RNU1-38P-201ENST00000362817 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.62□□□□□ -0.23
RNU1-38P-201ENST00000362817 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.61□□□□□ -0.23
RNU1-38P-201ENST00000362817 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.6□□□□□ -0.23
RNU1-38P-201ENST00000362817 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERCC6Q03468 1493 aa13.56□□□□□ -0.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.56□□□□□ -0.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 MICALL2Q8IY33 904 aa13.53□□□□□ -0.24
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.51□□□□□ -0.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.5□□□□□ -0.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.49□□□□□ -0.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.49□□□□□ -0.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 CFTRP13569 1480 aa13.48□□□□□ -0.25
RNU1-38P-201ENST00000362817 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CUX2O14529 1486 aa13.43□□□□□ -0.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R37O75864 691 aa13.42□□□□□ -0.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.4□□□□□ -0.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRDM2Q13029 1718 aa13.39□□□□□ -0.27
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.39□□□□□ -0.27
RNU1-38P-201ENST00000362817 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.38□□□□□ -0.27
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNPHO15079 494 aa13.38□□□□□ -0.27
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.36□□□□□ -0.27
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDR62O43379 1518 aa13.34□□□□□ -0.27
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMC2Q8TDI7 906 aa13.32□□□□□ -0.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.29□□□□□ -0.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIF3CO14782 793 aa13.27□□□□□ -0.29
RNU1-38P-201ENST00000362817 CFAP44Q96MT7 982 aa13.27□□□□□ -0.29
RNU1-38P-201ENST00000362817 C2orf72A6NCS6 295 aa13.24□□□□□ -0.29
RNU1-38P-201ENST00000362817 DOK7Q18PE1 504 aa13.24□□□□□ -0.29
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
RNU1-38P-201ENST00000362817 RIMBP2O15034 1052 aa13.21□□□□□ -0.29
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE4AP27815 886 aa13.21□□□□□ -0.29
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
RNU1-38P-201ENST00000362817 TOPBP1Q92547 1522 aa13.19□□□□□ -0.3
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXK1P85037 733 aa13.18□□□□□ -0.3
RNU1-38P-201ENST00000362817 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.18□□□□□ -0.3
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.18□□□□□ -0.3
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABCC8Q09428 1581 aa13.17□□□□□ -0.3
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.17□□□□□ -0.3
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.16□□□□□ -0.3
RNU1-38P-201ENST00000362817 ST18O60284 1047 aa13.13□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.13□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC34A2O95436 690 aa13.11□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 DSG2Q14126 1118 aa13.11□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 CUX1P39880 1505 aa13.11□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFT140Q96RY7 1462 aa13.1□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLCB2Q00722 1185 aa13.1□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLPP6Q8IY26 295 aa13.1□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.09□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.09□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFSD10Q14728 455 aa13.08□□□□□ -0.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.05□□□□□ -0.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.04□□□□□ -0.32
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D12O60347 775 aa13.02□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 SOGA1O94964 1423 aa13.02□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR153Q6NV75 609 aa13.01□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 POTEMA6NI47 508 aa13□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 EMP3P54852 163 aa13□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 POTEGQ6S5H5 508 aa13□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.99□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 SYNJ1O43426 1573 aa12.99□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 TOP2BQ02880 1626 aa12.99□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDR70Q9NW82 654 aa12.98□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.98□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARSIQ5FYB1 569 aa12.97□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.97□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDR97A6NE52 1622 aa12.97□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 MARVELD3Q96A59 401 aa12.96□□□□□ -0.33
RNU1-38P-201ENST00000362817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms