RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.74■□□□□ 0.91
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF15Q9NS87 1388 aa20.69■□□□□ 0.9
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.67■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PTMSP20962 102 aa20.66■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.65■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STK26Q9P289 416 aa20.65■□□□□ 0.9
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.63■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOLGA2Q08379 1002 aa20.63■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.62■□□□□ 0.89
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 EID1Q9Y6B2 187 aa20.57■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 HMMRO75330 724 aa20.52■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.52■□□□□ 0.87
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.51■□□□□ 0.87
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GBP4Q96PP9 640 aa20.5■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SOX12O15370 315 aa20.5■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.48■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP47Q96K76 1375 aa20.48■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.47■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.47■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.47■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EVC2Q86UK5 1308 aa20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.44■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPATCH3Q96I76 525 aa20.44■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PANK3Q9H999 370 aa20.42■□□□□ 0.86
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