RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358572.9

TMA16-201, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMA16, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-201ENST00000358572 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.83■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.81■■□□□ 1.24
TMA16-201ENST00000358572 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.81■■□□□ 1.24
TMA16-201ENST00000358572 ABCC2Q92887 1545 aa22.8■■□□□ 1.24
TMA16-201ENST00000358572 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.78■■□□□ 1.24
TMA16-201ENST00000358572 KDM6BO15054 1643 aa22.78■■□□□ 1.24
TMA16-201ENST00000358572 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-201ENST00000358572 NEUROD1Q13562 356 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-201ENST00000358572 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TMA16-201ENST00000358572 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TMA16-201ENST00000358572 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TMA16-201ENST00000358572 ADGRL2O95490 1459 aa22.71■■□□□ 1.23
TMA16-201ENST00000358572 NCOA1Q15788 1441 aa22.7■■□□□ 1.22
TMA16-201ENST00000358572 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.69■■□□□ 1.22
TMA16-201ENST00000358572 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.66■■□□□ 1.22
TMA16-201ENST00000358572 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.66■■□□□ 1.22
TMA16-201ENST00000358572 TRIM52Q96A61 297 aa22.66■■□□□ 1.22
TMA16-201ENST00000358572 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-201ENST00000358572 PREX2Q70Z35 1606 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-201ENST00000358572 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-201ENST00000358572 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.62■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.62■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 MBD5Q9P267 1494 aa22.62■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.62■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.61■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.6■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.58■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 TONSLQ96HA7 1378 aa22.58■■□□□ 1.21
TMA16-201ENST00000358572 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
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TMA16-201ENST00000358572 OSCARQ8IYS5 282 aa22.54■■□□□ 1.2
TMA16-201ENST00000358572 TSPY4P0CV99 314 aa22.54■■□□□ 1.2
TMA16-201ENST00000358572 TSPY10P0CW01 314 aa22.54■■□□□ 1.2
TMA16-201ENST00000358572 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.53■■□□□ 1.2
TMA16-201ENST00000358572 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.53■■□□□ 1.2
TMA16-201ENST00000358572 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.52■■□□□ 1.2
TMA16-201ENST00000358572 PZPP20742 1482 aa22.52■■□□□ 1.2
TMA16-201ENST00000358572 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.51■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 KCNH8Q96L42 1107 aa22.51■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.51■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.5■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 PLCH2O75038 1416 aa22.5■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.48■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 FOXD1Q16676 465 aa22.47■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.47■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 MIER1Q8N108 512 aa22.47■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 KIF15Q9NS87 1388 aa22.45■■□□□ 1.19
TMA16-201ENST00000358572 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.45■■□□□ 1.18
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TMA16-201ENST00000358572 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.43■■□□□ 1.18
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TMA16-201ENST00000358572 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.41■■□□□ 1.18
TMA16-201ENST00000358572 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.41■■□□□ 1.18
TMA16-201ENST00000358572 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.4■■□□□ 1.18
TMA16-201ENST00000358572 NUP155O75694 1391 aa22.36■■□□□ 1.17
TMA16-201ENST00000358572 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.36■■□□□ 1.17
TMA16-201ENST00000358572 ABCC1P33527 1531 aa22.36■■□□□ 1.17
TMA16-201ENST00000358572 PKD2Q13563 968 aa22.35■■□□□ 1.17
TMA16-201ENST00000358572 PLXNC1O60486 1568 aa22.35■■□□□ 1.17
TMA16-201ENST00000358572 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.33■■□□□ 1.17
TMA16-201ENST00000358572 ASXL2Q76L83 1435 aa22.32■■□□□ 1.16
TMA16-201ENST00000358572 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.32■■□□□ 1.16
TMA16-201ENST00000358572 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.3■■□□□ 1.16
TMA16-201ENST00000358572 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.26■■□□□ 1.15
TMA16-201ENST00000358572 UNC13BO14795 1591 aa22.26■■□□□ 1.15
TMA16-201ENST00000358572 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TMA16-201ENST00000358572 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.24■■□□□ 1.15
TMA16-201ENST00000358572 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.24■■□□□ 1.15
TMA16-201ENST00000358572 FANCAO15360 1455 aa22.24■■□□□ 1.15
TMA16-201ENST00000358572 ERBINQ96RT1 1412 aa22.23■■□□□ 1.15
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TMA16-201ENST00000358572 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.21■■□□□ 1.15
TMA16-201ENST00000358572 AFAP1Q8N556 730 aa22.19■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.19■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.18■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.17■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 ADGRL1O94910 1474 aa22.14■■□□□ 1.14
TMA16-201ENST00000358572 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.13■■□□□ 1.13
TMA16-201ENST00000358572 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMA16-201ENST00000358572 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.136e-6■■■□□ 15.7
TMA16-201ENST00000358572 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.1■■□□□ 1.13
TMA16-201ENST00000358572 PLA2R1Q13018 1463 aa22.1■■□□□ 1.13
TMA16-201ENST00000358572 ATP7AQ04656 1500 aa22.1■■□□□ 1.13
TMA16-201ENST00000358572 CD109Q6YHK3 1445 aa22.08■■□□□ 1.13
TMA16-201ENST00000358572 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.08■■□□□ 1.13
TMA16-201ENST00000358572 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TMA16-201ENST00000358572 ATP10AO60312 1499 aa22.06■■□□□ 1.12
TMA16-201ENST00000358572 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.05■■□□□ 1.12
TMA16-201ENST00000358572 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.04■■□□□ 1.12
TMA16-201ENST00000358572 DEPDC5O75140 1603 aa22.03■■□□□ 1.12
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