RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354454.7

LRMP-201, Transcript of lymphoid restricted membrane protein, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRMP, Length 2,504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMP-201ENST00000354454 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LRMP-201ENST00000354454 POTEAQ6S8J7 498 aa6.94□□□□□ -1.3
LRMP-201ENST00000354454 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.94□□□□□ -1.3
LRMP-201ENST00000354454 ZBTB22O15209 634 aa6.93□□□□□ -1.3
LRMP-201ENST00000354454 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.93□□□□□ -1.3
LRMP-201ENST00000354454 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
LRMP-201ENST00000354454 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
LRMP-201ENST00000354454 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.91□□□□□ -1.3
LRMP-201ENST00000354454 DISP1Q96F81 1524 aa6.91□□□□□ -1.3
LRMP-201ENST00000354454 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.9□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 KIAA0556O60303 1618 aa6.9□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.89□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 MLECQ14165 292 aa6.89□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.89□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.88□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.88□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.88□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 PTPRKQ15262 1439 aa6.88□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.87□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 RICTORQ6R327 1708 aa6.87□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 IQGAP2Q13576 1575 aa6.87□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 CPS1P31327 1500 aa6.86□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.86□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 ALKQ9UM73 1620 aa6.86□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.86□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 MYT1Q01538 1121 aa6.86□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 PKD2Q13563 968 aa6.86□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.85□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 IGF1RP08069 1367 aa6.84□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 BCANQ96GW7 911 aa6.84□□□□□ -1.31
LRMP-201ENST00000354454 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.83□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 KLHL34Q8N239 644 aa6.83□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 PLA2R1Q13018 1463 aa6.83□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 ABCA8O94911 1581 aa6.83□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 PLCB2Q00722 1185 aa6.82□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 ATP10AO60312 1499 aa6.82□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 C3P01024 1663 aa6.81□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.81□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 PPP6R1Q9UPN7 881 aa6.81□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.8□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.8□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 HECW1Q76N89 1606 aa6.78□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 NPATQ14207 1427 aa6.78□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 FOXD1Q16676 465 aa6.78□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.78□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LRMP-201ENST00000354454 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.77□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 HOMEZQ8IX15 550 aa6.76□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.76□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.76□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 ATP10BO94823 1461 aa6.76□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.76□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.74□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 AGLP35573 1532 aa6.74□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.74□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.74□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 KIF27Q86VH2 1401 aa6.74□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.73□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 TRIM52Q96A61 297 aa6.73□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.72□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 REREQ9P2R6 1566 aa6.72□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.72□□□□□ -1.33
LRMP-201ENST00000354454 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.71□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 GOLGA3Q08378 1498 aa6.71□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 MROH2AA6NES4 1674 aa6.7□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.69□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.69□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 RXRBP28702 533 aa6.69□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 LRP5O75197 1615 aa6.69□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.69□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 SYNMO15061 1565 aa6.68□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 ZMYM3Q14202 1370 aa6.67□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 ARID3CA6NKF2 412 aa6.66□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 FKBP8Q14318 412 aa6.66□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 YY1P25490 414 aa6.66□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.65□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.65□□□□□ -1.34
LRMP-201ENST00000354454 JCADQ9P266 1359 aa6.65□□□□□ -1.35
LRMP-201ENST00000354454 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LRMP-201ENST00000354454 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.64□□□□□ -1.35
LRMP-201ENST00000354454 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LRMP-201ENST00000354454 MED14O60244 1454 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.9 ms