RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF11O15085 1522 aa23.09■■□□□ 1.29
GDE1-201ENST00000353258 TONSLQ96HA7 1378 aa23.08■■□□□ 1.28
GDE1-201ENST00000353258 FBLN2P98095 1184 aa23.07■■□□□ 1.28
GDE1-201ENST00000353258 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
GDE1-201ENST00000353258 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.03■■□□□ 1.28
GDE1-201ENST00000353258 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GDE1-201ENST00000353258 DISP1Q96F81 1524 aa23.02■■□□□ 1.28
GDE1-201ENST00000353258 GRIN2AQ12879 1464 aa23.02■■□□□ 1.28
GDE1-201ENST00000353258 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GDE1-201ENST00000353258 KIAA0556O60303 1618 aa23■■□□□ 1.27
GDE1-201ENST00000353258 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GDE1-201ENST00000353258 KDM6BO15054 1643 aa22.96■■□□□ 1.27
GDE1-201ENST00000353258 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
GDE1-201ENST00000353258 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
GDE1-201ENST00000353258 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GDE1-201ENST00000353258 MIA2Q96PC5 1412 aa22.92■■□□□ 1.26
GDE1-201ENST00000353258 FOXD1Q16676 465 aa22.92■■□□□ 1.26
GDE1-201ENST00000353258 CCDC184Q52MB2 194 aa22.92■■□□□ 1.26
GDE1-201ENST00000353258 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.9■■□□□ 1.26
GDE1-201ENST00000353258 IL27Q8NEV9 243 aa22.9■■□□□ 1.26
GDE1-201ENST00000353258 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.9■■□□□ 1.26
GDE1-201ENST00000353258 CEP170Q5SW79 1584 aa22.88■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.87■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.87■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.86■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.86■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.85■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 SYNJ2O15056 1496 aa22.85■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 DAPK1P53355 1430 aa22.84■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.83■■□□□ 1.25
GDE1-201ENST00000353258 JPH4Q96JJ6 628 aa22.83■■□□□ 1.24
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
GDE1-201ENST00000353258 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
GDE1-201ENST00000353258 AKNAQ7Z591 1439 aa22.81■■□□□ 1.24
GDE1-201ENST00000353258 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.81■■□□□ 1.24
GDE1-201ENST00000353258 ABCC5O15440 1437 aa22.81■■□□□ 1.24
GDE1-201ENST00000353258 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
GDE1-201ENST00000353258 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GDE1-201ENST00000353258 MRS2Q9HD23 443 aa22.77■■□□□ 1.24
GDE1-201ENST00000353258 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.76■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.74■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.74■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 KIF14Q15058 1648 aa22.73■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 NUP160Q12769 1436 aa22.72■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 ROCK1Q13464 1354 aa22.71■■□□□ 1.23
GDE1-201ENST00000353258 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.7■■□□□ 1.22
GDE1-201ENST00000353258 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GDE1-201ENST00000353258 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.65■■□□□ 1.22
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.64■■□□□ 1.22
GDE1-201ENST00000353258 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.62■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.61■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 NCOA1Q15788 1441 aa22.6■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 NEFMP07197 916 aa22.6■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 CCDC7Q96M83 1385 aa22.6■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 ATP10BO94823 1461 aa22.58■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.58■■□□□ 1.21
GDE1-201ENST00000353258 NUDCQ9Y266 331 aa22.58■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.57■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 ABCA8O94911 1581 aa22.56■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.56■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 PZPP20742 1482 aa22.55■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 USP35Q9P2H5 1018 aa22.54■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.53■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.53■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.53■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.53■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 PKD2Q13563 968 aa22.52■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.52■■□□□ 1.2
GDE1-201ENST00000353258 PTPRGP23470 1445 aa22.51■■□□□ 1.19
GDE1-201ENST00000353258 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
GDE1-201ENST00000353258 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.5■■□□□ 1.19
GDE1-201ENST00000353258 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.49■■□□□ 1.19
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.49■■□□□ 1.19
GDE1-201ENST00000353258 ADGRL2O95490 1459 aa22.48■■□□□ 1.19
GDE1-201ENST00000353258 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.47■■□□□ 1.19
GDE1-201ENST00000353258 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.46■■□□□ 1.19
GDE1-201ENST00000353258 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.46■■□□□ 1.19
GDE1-201ENST00000353258 TSPY4P0CV99 314 aa22.45■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 TSPY10P0CW01 314 aa22.45■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.45■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.44■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 NUP155O75694 1391 aa22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.5 ms