RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-204ENST00000352260 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 AKNAQ7Z591 1439 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 DAPK1P53355 1430 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.95■■□□□ 1.91
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC5O15440 1437 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC2Q92887 1545 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS1-204ENST00000352260 ROCK1Q13464 1354 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS1-204ENST00000352260 KDM6BO15054 1643 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS1-204ENST00000352260 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 MIER1Q8N108 512 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-204ENST00000352260 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 PREX2Q70Z35 1606 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRL2O95490 1459 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-204ENST00000352260 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.873e-6■■□□□ 13.1
SPNS1-204ENST00000352260 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM52Q96A61 297 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 NCOA1Q15788 1441 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 MBD5Q9P267 1494 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 KCNH8Q96L42 1107 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 TONSLQ96HA7 1378 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 TSPY4P0CV99 314 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 TSPY10P0CW01 314 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS1-204ENST00000352260 PLCH2O75038 1416 aa26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 PZPP20742 1482 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 ASXL2Q76L83 1435 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 KIF15Q9NS87 1388 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 FOXD1Q16676 465 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.45■■□□□ 1.83
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS1-204ENST00000352260 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS1-204ENST00000352260 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.41■■□□□ 1.82
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC1P33527 1531 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-204ENST00000352260 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.39■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 DIP2BQ9P265 1576 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 PLXNC1O60486 1568 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 NUP155O75694 1391 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-204ENST00000352260 PKD2Q13563 968 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.28■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-204ENST00000352260 GLI2P10070 1586 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 FANCAO15360 1455 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 UNC13BO14795 1591 aa26.24■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.21■■□□□ 1.79
SPNS1-204ENST00000352260 ERBINQ96RT1 1412 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 AFAP1Q8N556 730 aa26.16■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRL1O94910 1474 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS1-204ENST00000352260 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms