RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 PLCH2O75038 1416 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-201ENST00000351328 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10.4□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 PREX2Q70Z35 1606 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 ANP32EQ9BTT0 268 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 MIA2Q96PC5 1412 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 TSPOAP1O95153 1857 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 FANCAO15360 1455 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 NEO1Q92859 1461 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 AKNAQ7Z591 1439 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-201ENST00000351328 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 ADGRL1O94910 1474 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 ABCC1P33527 1531 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 MBD5Q9P267 1494 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 RAPGEF3O95398 923 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 AFAP1Q8N556 730 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.27□□□□□ -0.76
CS-201ENST00000351328 CCDC141Q6ZP82 1450 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 TSPY4P0CV99 314 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 TSPY10P0CW01 314 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 KDM6BO15054 1643 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 ABCC5O15440 1437 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 RICTORQ6R327 1708 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 DAPK1P53355 1430 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 KDM5CP41229 1560 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 PLEKHG5O94827 1062 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 ITGAEP38570 1179 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 PTPRKQ15262 1439 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-201ENST00000351328 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.21□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 ATP7AQ04656 1500 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 ROCK1Q13464 1354 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 ADGRL2O95490 1459 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 NCOA1Q15788 1441 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 ATP10AO60312 1499 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 PLXNC1O60486 1568 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-201ENST00000351328 KIF15Q9NS87 1388 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms