RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.52■□□□□ 0.24
PGA3-201ENST00000325558 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.51■□□□□ 0.23
PGA3-201ENST00000325558 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.5■□□□□ 0.23
PGA3-201ENST00000325558 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.5■□□□□ 0.23
PGA3-201ENST00000325558 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PGA3-201ENST00000325558 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.48■□□□□ 0.23
PGA3-201ENST00000325558 ADGRL2O95490 1459 aa16.47■□□□□ 0.23
PGA3-201ENST00000325558 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.47■□□□□ 0.23
PGA3-201ENST00000325558 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.46■□□□□ 0.23
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PGA3-201ENST00000325558 ABCC2Q92887 1545 aa16.46■□□□□ 0.22
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PGA3-201ENST00000325558 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.45■□□□□ 0.22
PGA3-201ENST00000325558 NCOA1Q15788 1441 aa16.44■□□□□ 0.22
PGA3-201ENST00000325558 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.43■□□□□ 0.22
PGA3-201ENST00000325558 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.43■□□□□ 0.22
PGA3-201ENST00000325558 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.41■□□□□ 0.22
PGA3-201ENST00000325558 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.4■□□□□ 0.22
PGA3-201ENST00000325558 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.4■□□□□ 0.22
PGA3-201ENST00000325558 MBD5Q9P267 1494 aa16.39■□□□□ 0.22
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PGA3-201ENST00000325558 PREX2Q70Z35 1606 aa16.39■□□□□ 0.21
PGA3-201ENST00000325558 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.38■□□□□ 0.21
PGA3-201ENST00000325558 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
PGA3-201ENST00000325558 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.35■□□□□ 0.21
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.34■□□□□ 0.21
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PGA3-201ENST00000325558 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
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PGA3-201ENST00000325558 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.33■□□□□ 0.2
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.33■□□□□ 0.2
PGA3-201ENST00000325558 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
PGA3-201ENST00000325558 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.31■□□□□ 0.2
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PGA3-201ENST00000325558 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.3■□□□□ 0.2
PGA3-201ENST00000325558 TONSLQ96HA7 1378 aa16.3■□□□□ 0.2
PGA3-201ENST00000325558 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.29■□□□□ 0.2
PGA3-201ENST00000325558 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.28■□□□□ 0.2
PGA3-201ENST00000325558 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.28■□□□□ 0.2
PGA3-201ENST00000325558 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.28■□□□□ 0.2
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.28■□□□□ 0.2
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PGA3-201ENST00000325558 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.27■□□□□ 0.19
PGA3-201ENST00000325558 PLCH2O75038 1416 aa16.26■□□□□ 0.19
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PGA3-201ENST00000325558 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.23■□□□□ 0.19
PGA3-201ENST00000325558 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.23■□□□□ 0.19
PGA3-201ENST00000325558 TSPY4P0CV99 314 aa16.22■□□□□ 0.19
PGA3-201ENST00000325558 TSPY10P0CW01 314 aa16.22■□□□□ 0.19
PGA3-201ENST00000325558 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.22■□□□□ 0.19
PGA3-201ENST00000325558 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.22■□□□□ 0.19
PGA3-201ENST00000325558 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.21■□□□□ 0.19
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PGA3-201ENST00000325558 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.21■□□□□ 0.19
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PGA3-201ENST00000325558 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.15■□□□□ 0.18
PGA3-201ENST00000325558 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.15■□□□□ 0.18
PGA3-201ENST00000325558 UNC13BO14795 1591 aa16.14■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.14■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 NUP155O75694 1391 aa16.13■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 PKD2Q13563 968 aa16.13■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.11■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.11■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.1■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.1■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.09■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.09■□□□□ 0.17
PGA3-201ENST00000325558 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.08■□□□□ 0.16
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PGA3-201ENST00000325558 ASXL2Q76L83 1435 aa16.07■□□□□ 0.16
PGA3-201ENST00000325558 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.07■□□□□ 0.16
PGA3-201ENST00000325558 ERBINQ96RT1 1412 aa16.06■□□□□ 0.16
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PGA3-201ENST00000325558 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.06■□□□□ 0.16
PGA3-201ENST00000325558 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PGA3-201ENST00000325558 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PGA3-201ENST00000325558 PLA2R1Q13018 1463 aa16.04■□□□□ 0.16
PGA3-201ENST00000325558 ATP10AO60312 1499 aa16.03■□□□□ 0.16
PGA3-201ENST00000325558 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.02■□□□□ 0.16
PGA3-201ENST00000325558 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
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PGA3-201ENST00000325558 FANCAO15360 1455 aa16.01■□□□□ 0.15
PGA3-201ENST00000325558 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16■□□□□ 0.15
PGA3-201ENST00000325558 DEPDC5O75140 1603 aa15.98■□□□□ 0.15
PGA3-201ENST00000325558 AFAP1Q8N556 730 aa15.98■□□□□ 0.15
PGA3-201ENST00000325558 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PGA3-201ENST00000325558 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PGA3-201ENST00000325558 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PGA3-201ENST00000325558 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.96■□□□□ 0.15
PGA3-201ENST00000325558 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.95■□□□□ 0.14
PGA3-201ENST00000325558 CCER2I3L3R5 266 aa15.95■□□□□ 0.14
PGA3-201ENST00000325558 ATP7AQ04656 1500 aa15.95■□□□□ 0.14
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