RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323372.8

PIPOX-201, Transcript of pipecolic acid and sarcosine oxidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PIPOX, Length 2,414 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOX-201ENST00000323372 PTPRGP23470 1445 aa23.22■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.21■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PIPOX-201ENST00000323372 AKNAQ7Z591 1439 aa23.2■■□□□ 1.3
PIPOX-201ENST00000323372 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.2■■□□□ 1.3
PIPOX-201ENST00000323372 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.19■■□□□ 1.3
PIPOX-201ENST00000323372 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PIPOX-201ENST00000323372 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PIPOX-201ENST00000323372 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.18■■□□□ 1.3
PIPOX-201ENST00000323372 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PIPOX-201ENST00000323372 FOXD1Q16676 465 aa23.16■■□□□ 1.3
PIPOX-201ENST00000323372 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PIPOX-201ENST00000323372 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.13■■□□□ 1.29
PIPOX-201ENST00000323372 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.13■■□□□ 1.29
PIPOX-201ENST00000323372 ROCK1Q13464 1354 aa23.12■■□□□ 1.29
PIPOX-201ENST00000323372 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.1■■□□□ 1.29
PIPOX-201ENST00000323372 SHROOM2Q13796 1616 aa23.08■■□□□ 1.29
PIPOX-201ENST00000323372 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.08■■□□□ 1.29
PIPOX-201ENST00000323372 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.03■■□□□ 1.28
PIPOX-201ENST00000323372 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.03■■□□□ 1.28
PIPOX-201ENST00000323372 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PIPOX-201ENST00000323372 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PIPOX-201ENST00000323372 NCOA1Q15788 1441 aa23.02■■□□□ 1.28
PIPOX-201ENST00000323372 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23■■□□□ 1.27
PIPOX-201ENST00000323372 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
PIPOX-201ENST00000323372 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.97■■□□□ 1.27
PIPOX-201ENST00000323372 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.96■■□□□ 1.27
PIPOX-201ENST00000323372 ADGRL2O95490 1459 aa22.95■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 KCNH8Q96L42 1107 aa22.94■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.94■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.93■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 ABCC2Q92887 1545 aa22.93■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.92■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 PZPP20742 1482 aa22.92■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.92■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 TSPY4P0CV99 314 aa22.92■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 TSPY10P0CW01 314 aa22.92■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.92■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.9■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.9■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.9■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 PREX2Q70Z35 1606 aa22.89■■□□□ 1.26
PIPOX-201ENST00000323372 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
PIPOX-201ENST00000323372 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.86■■□□□ 1.25
PIPOX-201ENST00000323372 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.86■■□□□ 1.25
PIPOX-201ENST00000323372 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PIPOX-201ENST00000323372 MBD5Q9P267 1494 aa22.85■■□□□ 1.25
PIPOX-201ENST00000323372 PKD2Q13563 968 aa22.84■■□□□ 1.25
PIPOX-201ENST00000323372 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PIPOX-201ENST00000323372 KIF15Q9NS87 1388 aa22.83■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.82■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.82■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 NUP155O75694 1391 aa22.81■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.81■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.79■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.79■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.78■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.78■■□□□ 1.24
PIPOX-201ENST00000323372 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
PIPOX-201ENST00000323372 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.72■■□□□ 1.23
PIPOX-201ENST00000323372 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PIPOX-201ENST00000323372 ANP32CO43423 234 aa22.7■■□□□ 1.22
PIPOX-201ENST00000323372 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.7■■□□□ 1.22
PIPOX-201ENST00000323372 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.68■■□□□ 1.22
PIPOX-201ENST00000323372 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.222e-7■■□□□ 12.3
PIPOX-201ENST00000323372 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.68■■□□□ 1.22
PIPOX-201ENST00000323372 PLCH2O75038 1416 aa22.66■■□□□ 1.22
PIPOX-201ENST00000323372 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.65■■□□□ 1.22
PIPOX-201ENST00000323372 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.64■■□□□ 1.21
PIPOX-201ENST00000323372 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.63■■□□□ 1.21
PIPOX-201ENST00000323372 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PIPOX-201ENST00000323372 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.62■■□□□ 1.21
PIPOX-201ENST00000323372 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.61■■□□□ 1.21
PIPOX-201ENST00000323372 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.59■■□□□ 1.21
PIPOX-201ENST00000323372 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.59■■□□□ 1.21
PIPOX-201ENST00000323372 ABCC1P33527 1531 aa22.57■■□□□ 1.2
PIPOX-201ENST00000323372 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.56■■□□□ 1.2
PIPOX-201ENST00000323372 PLXNC1O60486 1568 aa22.56■■□□□ 1.2
PIPOX-201ENST00000323372 OSCARQ8IYS5 282 aa22.54■■□□□ 1.2
PIPOX-201ENST00000323372 AFAP1Q8N556 730 aa22.54■■□□□ 1.2
PIPOX-201ENST00000323372 CCER2I3L3R5 266 aa22.53■■□□□ 1.2
PIPOX-201ENST00000323372 CCDC7Q96M83 1385 aa22.53■■□□□ 1.2
PIPOX-201ENST00000323372 UNC13BO14795 1591 aa22.53■■□□□ 1.2
PIPOX-201ENST00000323372 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.52■■□□□ 1.2
PIPOX-201ENST00000323372 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.52■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.51■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.5■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.49■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.48■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 RGL3Q3MIN7 710 aa22.48■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.48■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 ASXL2Q76L83 1435 aa22.48■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 USP47Q96K76 1375 aa22.48■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.46■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 FANCAO15360 1455 aa22.46■■□□□ 1.19
PIPOX-201ENST00000323372 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.45■■□□□ 1.18
PIPOX-201ENST00000323372 ERBINQ96RT1 1412 aa22.45■■□□□ 1.18
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