RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 ZBED9Q6R2W3 1325 aa34.71■■■■□ 3.15
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SENP3-201ENST00000321337 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
SENP3-201ENST00000321337 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.7■■■■□ 3.15
SENP3-201ENST00000321337 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.7■■■■□ 3.14
SENP3-201ENST00000321337 AKNAQ7Z591 1439 aa34.68■■■■□ 3.14
SENP3-201ENST00000321337 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.65■■■■□ 3.14
SENP3-201ENST00000321337 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa34.62■■■■□ 3.13
SENP3-201ENST00000321337 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.6■■■■□ 3.13
SENP3-201ENST00000321337 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
SENP3-201ENST00000321337 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.59■■■■□ 3.13
SENP3-201ENST00000321337 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
SENP3-201ENST00000321337 MIA2Q96PC5 1412 aa34.57■■■■□ 3.12
SENP3-201ENST00000321337 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.55■■■■□ 3.12
SENP3-201ENST00000321337 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
SENP3-201ENST00000321337 DAPK1P53355 1430 aa34.51■■■■□ 3.11
SENP3-201ENST00000321337 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.5■■■■□ 3.11
SENP3-201ENST00000321337 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.5■■■■□ 3.11
SENP3-201ENST00000321337 ABCC5O15440 1437 aa34.48■■■■□ 3.11
SENP3-201ENST00000321337 WDR62O43379 1518 aa34.45■■■■□ 3.11
SENP3-201ENST00000321337 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
SENP3-201ENST00000321337 IQGAP2Q13576 1575 aa34.43■■■■□ 3.1
SENP3-201ENST00000321337 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
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SENP3-201ENST00000321337 ROCK1Q13464 1354 aa34.41■■■■□ 3.1
SENP3-201ENST00000321337 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
SENP3-201ENST00000321337 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
SENP3-201ENST00000321337 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
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SENP3-201ENST00000321337 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.34■■■■□ 3.09
SENP3-201ENST00000321337 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
SENP3-201ENST00000321337 DEKP35659 375 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
SENP3-201ENST00000321337 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.32■■■■□ 3.09
SENP3-201ENST00000321337 PZPP20742 1482 aa34.32■■■■□ 3.08
SENP3-201ENST00000321337 NBR1Q14596 966 aa34.31■■■■□ 3.08
SENP3-201ENST00000321337 USP47Q96K76 1375 aa34.29■■■■□ 3.08
SENP3-201ENST00000321337 PBRM1Q86U86 1689 aa34.28■■■■□ 3.08
SENP3-201ENST00000321337 CCDC136Q96JN2 1154 aa34.28■■■■□ 3.08
SENP3-201ENST00000321337 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.27■■■■□ 3.08
SENP3-201ENST00000321337 MBD5Q9P267 1494 aa34.24■■■■□ 3.07
SENP3-201ENST00000321337 ADAMTS12P58397 1594 aa34.23■■■■□ 3.07
SENP3-201ENST00000321337 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
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SENP3-201ENST00000321337 PKD2Q13563 968 aa34.18■■■■□ 3.06
SENP3-201ENST00000321337 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
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SENP3-201ENST00000321337 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.13■■■■□ 3.05
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SENP3-201ENST00000321337 TMC1Q8TDI8 760 aa34.12■■■■□ 3.05
SENP3-201ENST00000321337 KDM5CP41229 1560 aa34.11■■■■□ 3.05
SENP3-201ENST00000321337 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
SENP3-201ENST00000321337 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.11■■■■□ 3.05
SENP3-201ENST00000321337 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.1■■■■□ 3.05
SENP3-201ENST00000321337 KIAA0556O60303 1618 aa34.07■■■■□ 3.04
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SENP3-201ENST00000321337 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.02■■■■□ 3.04
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SENP3-201ENST00000321337 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
SENP3-201ENST00000321337 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa33.99■■■■□ 3.03
SENP3-201ENST00000321337 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
SENP3-201ENST00000321337 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
SENP3-201ENST00000321337 EXOC6Q8TAG9 804 aa33.97■■■■□ 3.03
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SENP3-201ENST00000321337 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.95■■■■□ 3.03
SENP3-201ENST00000321337 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.02
SENP3-201ENST00000321337 KIF15Q9NS87 1388 aa33.93■■■■□ 3.02
SENP3-201ENST00000321337 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.93■■■■□ 3.02
SENP3-201ENST00000321337 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.92■■■■□ 3.02
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SENP3-201ENST00000321337 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.91■■■■□ 3.02
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.91■■■■□ 3.02
SENP3-201ENST00000321337 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.91■■■■□ 3.02
SENP3-201ENST00000321337 ADGRL2O95490 1459 aa33.9■■■■□ 3.02
SENP3-201ENST00000321337 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
SENP3-201ENST00000321337 NUP155O75694 1391 aa33.9■■■■□ 3.02
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SENP3-201ENST00000321337 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.89■■■■□ 3.02
SENP3-201ENST00000321337 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
SENP3-201ENST00000321337 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.85■■■■□ 3.01
SENP3-201ENST00000321337 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
SENP3-201ENST00000321337 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.84■■■■□ 3.01
SENP3-201ENST00000321337 RCAN3Q9UKA8 241 aa33.82■■■■□ 3
SENP3-201ENST00000321337 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.81■■■■□ 3
SENP3-201ENST00000321337 RALBP1Q15311 655 aa33.79■■■■□ 3
SENP3-201ENST00000321337 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.79■■■■□ 3
SENP3-201ENST00000321337 CDCA7LQ96GN5 454 aa33.79■■■■□ 3
SENP3-201ENST00000321337 GRIN2AQ12879 1464 aa33.76■■■■□ 3
SENP3-201ENST00000321337 SKAP1Q86WV1 359 aa33.76■■■□□ 2.99
SENP3-201ENST00000321337 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
SENP3-201ENST00000321337 PDE4AP27815 886 aa33.73■■■□□ 2.99
SENP3-201ENST00000321337 PLIN1O60240 522 aa33.72■■■□□ 2.99
SENP3-201ENST00000321337 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.71■■■□□ 2.99
SENP3-201ENST00000321337 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.71■■■□□ 2.99
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