RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 FKBP8Q14318 412 aa26.99■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.98■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 ABCC5O15440 1437 aa26.98■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.97■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.95■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 AKNAQ7Z591 1439 aa26.93■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 JPH4Q96JJ6 628 aa26.91■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.9■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.9■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.86■■□□□ 1.89
NHLH2-201ENST00000320238 CEP170Q5SW79 1584 aa26.85■■□□□ 1.89
NHLH2-201ENST00000320238 ROCK1Q13464 1354 aa26.84■■□□□ 1.89
NHLH2-201ENST00000320238 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
NHLH2-201ENST00000320238 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 SYNJ2O15056 1496 aa26.81■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC184Q52MB2 194 aa26.8■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.79■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.78■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 NEFLP07196 543 aa26.76■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 KIF14Q15058 1648 aa26.76■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.74■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.74■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 NCOA1Q15788 1441 aa26.73■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 PKD2Q13563 968 aa26.72■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.72■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.69■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC7Q96M83 1385 aa26.69■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 PZPP20742 1482 aa26.68■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.67■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 NUP160Q12769 1436 aa26.66■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.66■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.65■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.62■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 ATP10BO94823 1461 aa26.6■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.6■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 MRS2Q9HD23 443 aa26.6■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 NUP155O75694 1391 aa26.59■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 TSPY4P0CV99 314 aa26.57■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 TSPY10P0CW01 314 aa26.57■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.57■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.56■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.55■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.54■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.52■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.52■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 ADGRL2O95490 1459 aa26.5■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 PTPRGP23470 1445 aa26.5■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 USP47Q96K76 1375 aa26.49■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.49■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 ABCA8O94911 1581 aa26.48■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.47■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 KIF15Q9NS87 1388 aa26.45■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.44■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.43■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.42■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.42■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.41■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 MBD5Q9P267 1494 aa26.4■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 RGL3Q3MIN7 710 aa26.36■■□□□ 1.81
NHLH2-201ENST00000320238 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.34■■□□□ 1.81
NHLH2-201ENST00000320238 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.32■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.31■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.29■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.28■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.25■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.25■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 KDM5CP41229 1560 aa26.23■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.21■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.21■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.21■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.21■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.2■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.2■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.19■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 TMC1Q8TDI8 760 aa26.18■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.18■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.18■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.16■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.16■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.15■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms