RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 AKNAQ7Z591 1439 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 HFM1A2PYH4 1435 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRKQ15262 1439 aa21.33■■□□□ 1
HOXA3-201ENST00000317201 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HOXA3-201ENST00000317201 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.29■■□□□ 1
HOXA3-201ENST00000317201 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXA3-201ENST00000317201 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 DAPK1P53355 1430 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 ROCK1Q13464 1354 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 NAIPQ13075 1403 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 PREX2Q70Z35 1606 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC5O15440 1437 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 ADGRL2O95490 1459 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 MAPKBP1O60336 1514 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 MIER1Q8N108 512 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 PLCH2O75038 1416 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 MBD5Q9P267 1494 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 NCOA1Q15788 1441 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 SLC24A1O60721 1099 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 KDM6BO15054 1643 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.02■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 ASXL2Q76L83 1435 aa21■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 KCNH8Q96L42 1107 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 TSPY4P0CV99 314 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 TSPY10P0CW01 314 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC1P33527 1531 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 BCANQ96GW7 911 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 PLXNC1O60486 1568 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM52Q96A61 297 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 KIF15Q9NS87 1388 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 FANCAO15360 1455 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 PZPP20742 1482 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 MSH5O43196 834 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 ERBINQ96RT1 1412 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 UNC13BO14795 1591 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 GLI2P10070 1586 aa20.77■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 CD109Q6YHK3 1445 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 ADGRL1O94910 1474 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 TONSLQ96HA7 1378 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms