RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317135.12

LRCH2-201, Transcript of leucine rich repeats and calponin homology domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRCH2, Length 4,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2-201ENST00000317135 CUL7Q14999 1698 aa23.41■■□□□ 1.34
LRCH2-201ENST00000317135 FKBP8Q14318 412 aa23.4■■□□□ 1.34
LRCH2-201ENST00000317135 MLECQ14165 292 aa23.39■■□□□ 1.33
LRCH2-201ENST00000317135 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.39■■□□□ 1.33
LRCH2-201ENST00000317135 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LRCH2-201ENST00000317135 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.36■■□□□ 1.33
LRCH2-201ENST00000317135 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.36■■□□□ 1.33
LRCH2-201ENST00000317135 TMF1P82094 1093 aa23.35■■□□□ 1.33
LRCH2-201ENST00000317135 SYNJ2O15056 1496 aa23.35■■□□□ 1.33
LRCH2-201ENST00000317135 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LRCH2-201ENST00000317135 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
LRCH2-201ENST00000317135 POGKQ9P215 609 aa23.33■■□□□ 1.32
LRCH2-201ENST00000317135 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
LRCH2-201ENST00000317135 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
LRCH2-201ENST00000317135 TIAM1Q13009 1591 aa23.29■■□□□ 1.32
LRCH2-201ENST00000317135 IQGAP2Q13576 1575 aa23.29■■□□□ 1.32
LRCH2-201ENST00000317135 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.28■■□□□ 1.32
LRCH2-201ENST00000317135 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
LRCH2-201ENST00000317135 HECW1Q76N89 1606 aa23.26■■□□□ 1.31
LRCH2-201ENST00000317135 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
LRCH2-201ENST00000317135 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.24■■□□□ 1.31
LRCH2-201ENST00000317135 CFAP53Q96M91 514 aa23.24■■□□□ 1.31
LRCH2-201ENST00000317135 GRIN2AQ12879 1464 aa23.23■■□□□ 1.31
LRCH2-201ENST00000317135 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
LRCH2-201ENST00000317135 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
LRCH2-201ENST00000317135 C14orf37Q86TY3 774 aa23.21■■□□□ 1.31
LRCH2-201ENST00000317135 UACAQ9BZF9 1416 aa23.2■■□□□ 1.31
LRCH2-201ENST00000317135 MIA2Q96PC5 1412 aa23.2■■□□□ 1.3
LRCH2-201ENST00000317135 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
LRCH2-201ENST00000317135 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.2■■□□□ 1.3
LRCH2-201ENST00000317135 KIF15Q9NS87 1388 aa23.2■■□□□ 1.3
LRCH2-201ENST00000317135 CCER2I3L3R5 266 aa23.19■■□□□ 1.3
LRCH2-201ENST00000317135 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
LRCH2-201ENST00000317135 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
LRCH2-201ENST00000317135 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.14■■□□□ 1.3
LRCH2-201ENST00000317135 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
LRCH2-201ENST00000317135 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.12■■□□□ 1.29
LRCH2-201ENST00000317135 MAP3K1Q13233 1512 aa23.1■■□□□ 1.29
LRCH2-201ENST00000317135 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
LRCH2-201ENST00000317135 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.09■■□□□ 1.29
LRCH2-201ENST00000317135 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LRCH2-201ENST00000317135 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
LRCH2-201ENST00000317135 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
LRCH2-201ENST00000317135 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.07■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 STK26Q9P289 416 aa23.06■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 NUDCQ9Y266 331 aa23.05■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 BCL11AQ9H165 835 aa23.04■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.03■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 HFM1A2PYH4 1435 aa23.02■■□□□ 1.28
LRCH2-201ENST00000317135 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 AFAP1Q8N556 730 aa23.01■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 MYT1Q01538 1121 aa23■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.99■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.99■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.98■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.97■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 RALBP1Q15311 655 aa22.97■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 MORC1Q86VD1 984 aa22.97■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.96■■□□□ 1.27
LRCH2-201ENST00000317135 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.95■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 DAPK1P53355 1430 aa22.95■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 PLEKHG5O94827 1062 aa22.93■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 USP47Q96K76 1375 aa22.91■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 STAC3Q96MF2 364 aa22.91■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 NEUROD2Q15784 382 aa22.9■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 EID1Q9Y6B2 187 aa22.89■■□□□ 1.26
LRCH2-201ENST00000317135 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.89■■□□□ 1.25
LRCH2-201ENST00000317135 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
LRCH2-201ENST00000317135 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
LRCH2-201ENST00000317135 ROCK1Q13464 1354 aa22.87■■□□□ 1.25
LRCH2-201ENST00000317135 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.86■■□□□ 1.25
LRCH2-201ENST00000317135 ARHGEF11O15085 1522 aa22.85■■□□□ 1.25
LRCH2-201ENST00000317135 NAIPQ13075 1403 aa22.84■■□□□ 1.25
LRCH2-201ENST00000317135 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.83■■□□□ 1.25
LRCH2-201ENST00000317135 ADAMTS12P58397 1594 aa22.82■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.81■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.81■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.81■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.8■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 WDR62O43379 1518 aa22.8■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 KIF14Q15058 1648 aa22.79■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 NLRP13Q86W25 1043 aa22.79■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.78■■□□□ 1.24
LRCH2-201ENST00000317135 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.77■■□□□ 1.24
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