RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CHTF18-202ENST00000317063 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.2■■□□□ 1.46
CHTF18-202ENST00000317063 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.467e-7■■■□□ 16.5
CHTF18-202ENST00000317063 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.2■■□□□ 1.46
CHTF18-202ENST00000317063 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.18■■□□□ 1.46
CHTF18-202ENST00000317063 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.17■■□□□ 1.46
CHTF18-202ENST00000317063 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.16■■□□□ 1.46
CHTF18-202ENST00000317063 ASXL2Q76L83 1435 aa24.16■■□□□ 1.46
CHTF18-202ENST00000317063 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.461e-7■■■□□ 17.2
CHTF18-202ENST00000317063 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.15■■□□□ 1.46
CHTF18-202ENST00000317063 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.14■■□□□ 1.46
CHTF18-202ENST00000317063 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.12■■□□□ 1.45
CHTF18-202ENST00000317063 ABCC5O15440 1437 aa24.11■■□□□ 1.45
CHTF18-202ENST00000317063 DAPK1P53355 1430 aa24.1■■□□□ 1.45
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.08■■□□□ 1.45
CHTF18-202ENST00000317063 PREX2Q70Z35 1606 aa24.06■■□□□ 1.44
CHTF18-202ENST00000317063 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.05■■□□□ 1.44
CHTF18-202ENST00000317063 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CHTF18-202ENST00000317063 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CHTF18-202ENST00000317063 NAIPQ13075 1403 aa24.04■■□□□ 1.44
CHTF18-202ENST00000317063 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.03■■□□□ 1.44
CHTF18-202ENST00000317063 HFM1A2PYH4 1435 aa24.02■■□□□ 1.44
CHTF18-202ENST00000317063 PLCH2O75038 1416 aa24.01■■□□□ 1.43
CHTF18-202ENST00000317063 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CHTF18-202ENST00000317063 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.99■■□□□ 1.43
CHTF18-202ENST00000317063 KDM6BO15054 1643 aa23.98■■□□□ 1.43
CHTF18-202ENST00000317063 TSPY4P0CV99 314 aa23.96■■□□□ 1.43
CHTF18-202ENST00000317063 TSPY10P0CW01 314 aa23.96■■□□□ 1.43
CHTF18-202ENST00000317063 MBD5Q9P267 1494 aa23.96■■□□□ 1.43
CHTF18-202ENST00000317063 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.96■■□□□ 1.43
CHTF18-202ENST00000317063 AKNAQ7Z591 1439 aa23.95■■□□□ 1.42
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.94■■□□□ 1.42
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM52Q96A61 297 aa23.93■■□□□ 1.42
CHTF18-202ENST00000317063 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.93■■□□□ 1.42
CHTF18-202ENST00000317063 NCOA1Q15788 1441 aa23.91■■□□□ 1.42
CHTF18-202ENST00000317063 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.9■■□□□ 1.42
CHTF18-202ENST00000317063 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.9■■□□□ 1.42
CHTF18-202ENST00000317063 AFAP1Q8N556 730 aa23.9■■□□□ 1.42
CHTF18-202ENST00000317063 ROCK1Q13464 1354 aa23.88■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 FANCAO15360 1455 aa23.88■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 CD109Q6YHK3 1445 aa23.87■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.87■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.86■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.86■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.86■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.85■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.84■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.83■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 MAPKBP1O60336 1514 aa23.83■■□□□ 1.41
CHTF18-202ENST00000317063 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.82■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.82■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.82■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 ABCC1P33527 1531 aa23.81■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 NEUROD1Q13562 356 aa23.8■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRL2O95490 1459 aa23.8■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.79■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.79■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 FOXD1Q16676 465 aa23.79■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.79■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 KIF15Q9NS87 1388 aa23.79■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.78■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRL1O94910 1474 aa23.78■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.77■■□□□ 1.4
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.76■■□□□ 1.39
CHTF18-202ENST00000317063 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CHTF18-202ENST00000317063 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.74■■□□□ 1.39
CHTF18-202ENST00000317063 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CHTF18-202ENST00000317063 TSPOAP1O95153 1857 aa23.73■■□□□ 1.39
CHTF18-202ENST00000317063 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.72■■□□□ 1.39
CHTF18-202ENST00000317063 RAPGEF3O95398 923 aa23.7■■□□□ 1.39
CHTF18-202ENST00000317063 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CHTF18-202ENST00000317063 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.7■■□□□ 1.38
CHTF18-202ENST00000317063 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CHTF18-202ENST00000317063 DIP2BQ9P265 1576 aa23.69■■□□□ 1.38
CHTF18-202ENST00000317063 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.68■■□□□ 1.38
CHTF18-202ENST00000317063 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.381e-6■■□□□ 14.5
CHTF18-202ENST00000317063 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.67■■□□□ 1.38
CHTF18-202ENST00000317063 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CHTF18-202ENST00000317063 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.65■■□□□ 1.38
CHTF18-202ENST00000317063 NUP155O75694 1391 aa23.64■■□□□ 1.38
CHTF18-202ENST00000317063 GLI2P10070 1586 aa23.62■■□□□ 1.37
CHTF18-202ENST00000317063 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.6■■□□□ 1.37
CHTF18-202ENST00000317063 PZPP20742 1482 aa23.6■■□□□ 1.37
CHTF18-202ENST00000317063 PLXNC1O60486 1568 aa23.58■■□□□ 1.37
CHTF18-202ENST00000317063 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.58■■□□□ 1.37
CHTF18-202ENST00000317063 PKD2Q13563 968 aa23.58■■□□□ 1.37
CHTF18-202ENST00000317063 ATP7AQ04656 1500 aa23.58■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.58■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.57■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.57■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 NEO1Q92859 1461 aa23.56■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.56■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.56■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.55■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.54■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 KIF3BO15066 747 aa23.52■■□□□ 1.36
CHTF18-202ENST00000317063 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.48■■□□□ 1.35
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