RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.09■□□□□ 0.81
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KCNS1-201ENST00000306117 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.06■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.06■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 MSH5O43196 834 aa20.05■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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KCNS1-201ENST00000306117 SLC4A3P48751 1232 aa20.01■□□□□ 0.79
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KCNS1-201ENST00000306117 NUP155O75694 1391 aa19.93■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.92■□□□□ 0.78
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KCNS1-201ENST00000306117 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
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KCNS1-201ENST00000306117 USP47Q96K76 1375 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.84■□□□□ 0.77
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KCNS1-201ENST00000306117 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 RALBP1Q15311 655 aa19.83■□□□□ 0.76
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KCNS1-201ENST00000306117 NLRP13Q86W25 1043 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 CUX1P39880 1505 aa19.81■□□□□ 0.76
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KCNS1-201ENST00000306117 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 TOP2BQ02880 1626 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP53Q96M91 514 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.78■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.78■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
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KCNS1-201ENST00000306117 TIAM1Q13009 1591 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 CFTRP13569 1480 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 GBP4Q96PP9 640 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 PANK3Q9H999 370 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 NCOA2Q15596 1464 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 SKAP1Q86WV1 359 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 CDCA8Q53HL2 280 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 KIF15Q9NS87 1388 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 IL27Q8NEV9 243 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.7■□□□□ 0.74
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KCNS1-201ENST00000306117 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
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KCNS1-201ENST00000306117 DRC7Q8IY82 874 aa19.67■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.67■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.66■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.66■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 MS4A1P11836 297 aa19.66■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.66■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 HFM1A2PYH4 1435 aa19.65■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 PDE3BQ13370 1112 aa19.64■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 NRDCO43847 1150 aa19.64■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 NAIPQ13075 1403 aa19.63■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 NCAPD3P42695 1498 aa19.62■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.62■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
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