RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299353.6

BORCS7-ASMT-201, Transcript of BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene BORCS7-ASMT, Length 2,670 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TRPC6Q9Y210 931 aa10.23□□□□□ -0.77
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KIF27Q86VH2 1401 aa10.23□□□□□ -0.77
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.22□□□□□ -0.77
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CFTRP13569 1480 aa10.22□□□□□ -0.77
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CUX2O14529 1486 aa10.21□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.19□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.17□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.17□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.17□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 IGF1RP08069 1367 aa10.16□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.14□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KIF12Q96FN5 646 aa10.14□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.14□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ANP32EQ9BTT0 268 aa10.14□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.13□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NESP48681 1621 aa10.12□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.12□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.11□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.1□□□□□ -0.79
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PSEN1P49768 467 aa10.08□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.08□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CABP2Q9NPB3 220 aa10.08□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.07□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.07□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FHOD3Q2V2M9 1422 aa10.06□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HAX1O00165 279 aa10.05□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.05□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.05□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.05□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.05□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PPP1R37O75864 691 aa10.05□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MFRPQ9BY79 579 aa10.05□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.03□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C19orf67A6NJJ6 358 aa10.02□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KCNH8Q96L42 1107 aa10.02□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ARID3CA6NKF2 412 aa10.01□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TIAM1Q13009 1591 aa10.01□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PHF8Q9UPP1 1060 aa10□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TOPBP1Q92547 1522 aa9.99□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 WDR97A6NE52 1622 aa9.98□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.96□□□□□ -0.81
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MAPKBP1O60336 1514 aa9.96□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.95□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.95□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.94□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.94□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.94□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.93□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.93□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.92□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.91□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.91□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.9□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.9□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.9□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.9□□□□□ -0.82
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.88□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PTPRKQ15262 1439 aa9.87□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.87□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.87□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.87□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.86□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MAP3K1Q13233 1512 aa9.86□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.86□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.85□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.85□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.831e-9■■■■■ 37.7
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 WDR62O43379 1518 aa9.84□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 BCANQ96GW7 911 aa9.84□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.84□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 POTEHQ6S545 545 aa9.84□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.84□□□□□ -0.83
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.83□□□□□ -0.84
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FMN1Q68DA7 1419 aa9.83□□□□□ -0.84
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CUL7Q14999 1698 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms