RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-201ENST00000299314 PTMSP20962 102 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-201ENST00000299314 KANK1Q14678 1352 aa30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.61■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA2Q08379 1002 aa30.6■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 NPHP1O15259 732 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SOGA1O94964 1423 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 APBB1O00213 710 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RALBP1Q15311 655 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SOX12O15370 315 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA2012Q0VF49 1180 aa30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXD1Q16676 465 aa30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PKD2Q13563 968 aa30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.48
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa30.47■■■□□ 2.47
GNPTAB-201ENST00000299314 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
GNPTAB-201ENST00000299314 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
GNPTAB-201ENST00000299314 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.46■■■□□ 2.47
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.46■■■□□ 2.47
GNPTAB-201ENST00000299314 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CUX2O14529 1486 aa30.44■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ARID3AQ99856 593 aa30.43■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 NACADO15069 1562 aa30.39■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.38■■■□□ 2.45
GNPTAB-201ENST00000299314 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
GNPTAB-201ENST00000299314 STK26Q9P289 416 aa30.36■■■□□ 2.45
GNPTAB-201ENST00000299314 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CLSTN1O94985 981 aa30.3■■■□□ 2.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.3■■■□□ 2.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ERCC6Q03468 1493 aa30.26■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TPM4P67936 248 aa30.25■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXD4L1Q9NU39 408 aa30.24■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 NUP155O75694 1391 aa30.24■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE3BQ13370 1112 aa30.23■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 MLECQ14165 292 aa30.23■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.23■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 GGT6Q6P531 493 aa30.21■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa30.21■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.2■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.2■■■□□ 2.43
GNPTAB-201ENST00000299314 FMN1Q68DA7 1419 aa30.19■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa30.19■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRP13Q86W25 1043 aa30.18■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 STK31Q9BXU1 1019 aa30.18■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 HMMRO75330 724 aa30.17■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCC8Q09428 1581 aa30.17■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 GPATCH3Q96I76 525 aa30.16■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.16■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.16■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
GNPTAB-201ENST00000299314 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
GNPTAB-201ENST00000299314 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
GNPTAB-201ENST00000299314 USP35Q9P2H5 1018 aa30.12■■■□□ 2.41
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX11L8A8MPP1 907 aa30.11■■■□□ 2.41
GNPTAB-201ENST00000299314 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
GNPTAB-201ENST00000299314 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF14O94880 888 aa30.1■■■□□ 2.41
GNPTAB-201ENST00000299314 ST18O60284 1047 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-201ENST00000299314 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF15Q9NS87 1388 aa30.07■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.07■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.07■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.07■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 GORABQ5T7V8 394 aa30.05■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE4AP27815 886 aa30.05■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC34Q96HJ3 373 aa30.04■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM161AQ3B820 660 aa30.03■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa30.03■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.03■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms