RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.61■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.61■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 DAPK1P53355 1430 aa15.59■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.58■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
COPS2-201ENST00000299259 NAIPQ13075 1403 aa15.57■□□□□ 0.08
COPS2-201ENST00000299259 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
COPS2-201ENST00000299259 ABCC5O15440 1437 aa15.55■□□□□ 0.08
COPS2-201ENST00000299259 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.54■□□□□ 0.08
COPS2-201ENST00000299259 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
COPS2-201ENST00000299259 MAPKBP1O60336 1514 aa15.54■□□□□ 0.08
COPS2-201ENST00000299259 ROCK1Q13464 1354 aa15.52■□□□□ 0.08
COPS2-201ENST00000299259 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.52■□□□□ 0.08
COPS2-201ENST00000299259 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.51■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.51■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.51■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 KDM6BO15054 1643 aa15.5■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 ADGRL2O95490 1459 aa15.49■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.49■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.48■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS2-201ENST00000299259 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.46■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 MBD5Q9P267 1494 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 KCNH8Q96L42 1107 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 ASXL2Q76L83 1435 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 PLCH2O75038 1416 aa15.42■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 NCOA1Q15788 1441 aa15.42■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 ABCC1P33527 1531 aa15.42■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.42■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.41■□□□□ 0.06
COPS2-201ENST00000299259 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.39■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 PLXNC1O60486 1568 aa15.38■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.35■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.35■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 TSPY4P0CV99 314 aa15.34■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 TSPY10P0CW01 314 aa15.34■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.34■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.34■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.34■□□□□ 0.05
COPS2-201ENST00000299259 FANCAO15360 1455 aa15.33■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 KIF15Q9NS87 1388 aa15.33■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 TRIM52Q96A61 297 aa15.33■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.29■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 PZPP20742 1482 aa15.29■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.29■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 UNC13BO14795 1591 aa15.28■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.27■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.27■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 ADGRL1O94910 1474 aa15.27■□□□□ 0.04
COPS2-201ENST00000299259 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.27■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.26■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 NEUROD1Q13562 356 aa15.26■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.25■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.24■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.24■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 CD109Q6YHK3 1445 aa15.24■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 ATP7AQ04656 1500 aa15.23■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 ERBINQ96RT1 1412 aa15.23■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 TONSLQ96HA7 1378 aa15.23■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.22■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 GLI2P10070 1586 aa15.22■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.21■□□□□ 0.03
COPS2-201ENST00000299259 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.21■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 DIP2BQ9P265 1576 aa15.2■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.19■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.19■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.19■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.19■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 NUP155O75694 1391 aa15.19■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.19■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 KDM5CP41229 1560 aa15.18■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 NEO1Q92859 1461 aa15.18■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 DEPDC5O75140 1603 aa15.17■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 FOXD1Q16676 465 aa15.17■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.17■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.16■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 AFAP1Q8N556 730 aa15.16■□□□□ 0.02
COPS2-201ENST00000299259 RICTORQ6R327 1708 aa15.13■□□□□ 0.01
COPS2-201ENST00000299259 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.13■□□□□ 0.01
COPS2-201ENST00000299259 PKD2Q13563 968 aa15.12■□□□□ 0.01
COPS2-201ENST00000299259 TSPOAP1O95153 1857 aa15.12■□□□□ 0.01
COPS2-201ENST00000299259 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 362.1 ms