RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.93■■□□□ 1.42
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PRKCI-201ENST00000295797 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
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PRKCI-201ENST00000295797 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
PRKCI-201ENST00000295797 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
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PRKCI-201ENST00000295797 MS4A1P11836 297 aa23.84■■□□□ 1.41
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PRKCI-201ENST00000295797 NUP155O75694 1391 aa23.83■■□□□ 1.41
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PRKCI-201ENST00000295797 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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PRKCI-201ENST00000295797 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.49■■□□□ 1.35
PRKCI-201ENST00000295797 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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PRKCI-201ENST00000295797 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.46■■□□□ 1.35
PRKCI-201ENST00000295797 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.46■■□□□ 1.35
PRKCI-201ENST00000295797 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.45■■□□□ 1.35
PRKCI-201ENST00000295797 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.45■■□□□ 1.35
PRKCI-201ENST00000295797 UACAQ9BZF9 1416 aa23.45■■□□□ 1.35
PRKCI-201ENST00000295797 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.45■■□□□ 1.34
PRKCI-201ENST00000295797 ARAP1Q96P48 1450 aa23.44■■□□□ 1.34
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