RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292408.8

FGFR4-201, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGFR4, Length 3,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-201ENST00000292408 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.35■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.34■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.33■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.33■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.33■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
FGFR4-201ENST00000292408 NCOA1Q15788 1441 aa22.29■■□□□ 1.16
FGFR4-201ENST00000292408 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.28■■□□□ 1.16
FGFR4-201ENST00000292408 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
FGFR4-201ENST00000292408 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.27■■□□□ 1.16
FGFR4-201ENST00000292408 CUL7Q14999 1698 aa22.27■■□□□ 1.16
FGFR4-201ENST00000292408 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
FGFR4-201ENST00000292408 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.26■■□□□ 1.15
FGFR4-201ENST00000292408 TMC1Q8TDI8 760 aa22.25■■□□□ 1.15
FGFR4-201ENST00000292408 PKD2Q13563 968 aa22.23■■□□□ 1.15
FGFR4-201ENST00000292408 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FGFR4-201ENST00000292408 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
FGFR4-201ENST00000292408 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.21■■□□□ 1.15
FGFR4-201ENST00000292408 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.21■■□□□ 1.15
FGFR4-201ENST00000292408 FBLN2P98095 1184 aa22.2■■□□□ 1.14
FGFR4-201ENST00000292408 SAMD9Q5K651 1589 aa22.2■■□□□ 1.14
FGFR4-201ENST00000292408 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-201ENST00000292408 NUDCQ9Y266 331 aa22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-201ENST00000292408 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FGFR4-201ENST00000292408 USP47Q96K76 1375 aa22.15■■□□□ 1.14
FGFR4-201ENST00000292408 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.15■■□□□ 1.14
FGFR4-201ENST00000292408 ABCC5O15440 1437 aa22.14■■□□□ 1.14
FGFR4-201ENST00000292408 DAPK1P53355 1430 aa22.14■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 SKAP1Q86WV1 359 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 ARHGEF11O15085 1522 aa22.1■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.1■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.09■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 HECW1Q76N89 1606 aa22.09■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.09■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.08■■□□□ 1.13
FGFR4-201ENST00000292408 RGL3Q3MIN7 710 aa22.08■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 MIA2Q96PC5 1412 aa22.06■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.06■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.04■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 PLIN1O60240 522 aa22.04■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FGFR4-201ENST00000292408 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.01■■□□□ 1.11
FGFR4-201ENST00000292408 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
FGFR4-201ENST00000292408 NUP155O75694 1391 aa22■■□□□ 1.11
FGFR4-201ENST00000292408 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FGFR4-201ENST00000292408 IQGAP2Q13576 1575 aa21.99■■□□□ 1.11
FGFR4-201ENST00000292408 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FGFR4-201ENST00000292408 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
FGFR4-201ENST00000292408 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.111e-8■■■■□ 21.1
FGFR4-201ENST00000292408 PZPP20742 1482 aa21.96■■□□□ 1.11
FGFR4-201ENST00000292408 ROCK1Q13464 1354 aa21.95■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 WDR62O43379 1518 aa21.94■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.94■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.94■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.91■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.91■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
FGFR4-201ENST00000292408 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.89■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.89■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.88■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 TSPY4P0CV99 314 aa21.88■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 TSPY10P0CW01 314 aa21.88■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.87■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.87■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 PDE4AP27815 886 aa21.86■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.86■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 KIF15Q9NS87 1388 aa21.86■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 SLC4A3P48751 1232 aa21.84■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.84■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
FGFR4-201ENST00000292408 NEFMP07197 916 aa21.82■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.82■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 DISP1Q96F81 1524 aa21.81■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 IL27Q8NEV9 243 aa21.8■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 CRBNQ96SW2 442 aa21.8■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 RALBP1Q15311 655 aa21.79■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.78■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 NLRP13Q86W25 1043 aa21.78■■□□□ 1.08
FGFR4-201ENST00000292408 ADAMTS12P58397 1594 aa21.77■■□□□ 1.07
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