RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292377.3

GPC2-201, Transcript of glypican 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC2, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2-201ENST00000292377 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.31■■□□□ 1.8
GPC2-201ENST00000292377 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
GPC2-201ENST00000292377 FOXD1Q16676 465 aa26.28■■□□□ 1.8
GPC2-201ENST00000292377 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
GPC2-201ENST00000292377 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
GPC2-201ENST00000292377 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.27■■□□□ 1.8
GPC2-201ENST00000292377 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GPC2-201ENST00000292377 AKNAQ7Z591 1439 aa26.26■■□□□ 1.79
GPC2-201ENST00000292377 TONSLQ96HA7 1378 aa26.26■■□□□ 1.79
GPC2-201ENST00000292377 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.26■■□□□ 1.79
GPC2-201ENST00000292377 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.24■■□□□ 1.79
GPC2-201ENST00000292377 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.23■■□□□ 1.79
GPC2-201ENST00000292377 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.22■■□□□ 1.79
GPC2-201ENST00000292377 ROCK1Q13464 1354 aa26.2■■□□□ 1.78
GPC2-201ENST00000292377 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
GPC2-201ENST00000292377 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.17■■□□□ 1.78
GPC2-201ENST00000292377 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.16■■□□□ 1.78
GPC2-201ENST00000292377 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.14■■□□□ 1.77
GPC2-201ENST00000292377 SHROOM2Q13796 1616 aa26.13■■□□□ 1.77
GPC2-201ENST00000292377 NCOA1Q15788 1441 aa26.11■■□□□ 1.77
GPC2-201ENST00000292377 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GPC2-201ENST00000292377 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
GPC2-201ENST00000292377 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.09■■□□□ 1.77
GPC2-201ENST00000292377 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
GPC2-201ENST00000292377 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
GPC2-201ENST00000292377 KCNH8Q96L42 1107 aa26.02■■□□□ 1.76
GPC2-201ENST00000292377 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.01■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.01■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.99■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.98■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 ADGRL2O95490 1459 aa25.98■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.98■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 PZPP20742 1482 aa25.97■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.97■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 TSPY4P0CV99 314 aa25.96■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 TSPY10P0CW01 314 aa25.96■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 ABCC2Q92887 1545 aa25.96■■□□□ 1.75
GPC2-201ENST00000292377 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.95■■□□□ 1.74
GPC2-201ENST00000292377 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.94■■□□□ 1.74
GPC2-201ENST00000292377 MBD5Q9P267 1494 aa25.92■■□□□ 1.74
GPC2-201ENST00000292377 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.92■■□□□ 1.74
GPC2-201ENST00000292377 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.92■■□□□ 1.74
GPC2-201ENST00000292377 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
GPC2-201ENST00000292377 PKD2Q13563 968 aa25.9■■□□□ 1.74
GPC2-201ENST00000292377 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
GPC2-201ENST00000292377 PREX2Q70Z35 1606 aa25.88■■□□□ 1.73
GPC2-201ENST00000292377 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.87■■□□□ 1.73
GPC2-201ENST00000292377 KIF15Q9NS87 1388 aa25.86■■□□□ 1.73
GPC2-201ENST00000292377 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.86■■□□□ 1.73
GPC2-201ENST00000292377 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.85■■□□□ 1.73
GPC2-201ENST00000292377 NUP155O75694 1391 aa25.85■■□□□ 1.73
GPC2-201ENST00000292377 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
GPC2-201ENST00000292377 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.82■■□□□ 1.72
GPC2-201ENST00000292377 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
GPC2-201ENST00000292377 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.81■■□□□ 1.72
GPC2-201ENST00000292377 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.81■■□□□ 1.72
GPC2-201ENST00000292377 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.81■■□□□ 1.72
GPC2-201ENST00000292377 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.81■■□□□ 1.72
GPC2-201ENST00000292377 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
GPC2-201ENST00000292377 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.74■■□□□ 1.71
GPC2-201ENST00000292377 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.74■■□□□ 1.71
GPC2-201ENST00000292377 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.73■■□□□ 1.71
GPC2-201ENST00000292377 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.73■■□□□ 1.71
GPC2-201ENST00000292377 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.72■■□□□ 1.71
GPC2-201ENST00000292377 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
GPC2-201ENST00000292377 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
GPC2-201ENST00000292377 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
GPC2-201ENST00000292377 PLCH2O75038 1416 aa25.69■■□□□ 1.7
GPC2-201ENST00000292377 ANP32CO43423 234 aa25.68■■□□□ 1.7
GPC2-201ENST00000292377 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.67■■□□□ 1.7
GPC2-201ENST00000292377 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.62■■□□□ 1.69
GPC2-201ENST00000292377 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.62■■□□□ 1.69
GPC2-201ENST00000292377 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.61■■□□□ 1.69
GPC2-201ENST00000292377 AFAP1Q8N556 730 aa25.6■■□□□ 1.69
GPC2-201ENST00000292377 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.6■■□□□ 1.69
GPC2-201ENST00000292377 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.6■■□□□ 1.69
GPC2-201ENST00000292377 OSCARQ8IYS5 282 aa25.59■■□□□ 1.69
GPC2-201ENST00000292377 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.58■■□□□ 1.69
GPC2-201ENST00000292377 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.55■■□□□ 1.68
GPC2-201ENST00000292377 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.54■■□□□ 1.68
GPC2-201ENST00000292377 ABCC1P33527 1531 aa25.54■■□□□ 1.68
GPC2-201ENST00000292377 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.53■■□□□ 1.68
GPC2-201ENST00000292377 CCDC7Q96M83 1385 aa25.52■■□□□ 1.68
GPC2-201ENST00000292377 CCER2I3L3R5 266 aa25.52■■□□□ 1.68
GPC2-201ENST00000292377 PLXNC1O60486 1568 aa25.5■■□□□ 1.67
GPC2-201ENST00000292377 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.49■■□□□ 1.67
GPC2-201ENST00000292377 RGL3Q3MIN7 710 aa25.49■■□□□ 1.67
GPC2-201ENST00000292377 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GPC2-201ENST00000292377 ASXL2Q76L83 1435 aa25.48■■□□□ 1.67
GPC2-201ENST00000292377 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.47■■□□□ 1.67
GPC2-201ENST00000292377 PLA2R1Q13018 1463 aa25.47■■□□□ 1.67
GPC2-201ENST00000292377 UNC13BO14795 1591 aa25.47■■□□□ 1.67
GPC2-201ENST00000292377 USP47Q96K76 1375 aa25.46■■□□□ 1.67
GPC2-201ENST00000292377 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.44■■□□□ 1.66
GPC2-201ENST00000292377 FANCAO15360 1455 aa25.44■■□□□ 1.66
GPC2-201ENST00000292377 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.43■■□□□ 1.66
GPC2-201ENST00000292377 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.42■■□□□ 1.66
GPC2-201ENST00000292377 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms