RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC184Q52MB2 194 aa25.76■■□□□ 1.71
CNOT11-201ENST00000289382 NBR1Q14596 966 aa25.74■■□□□ 1.71
CNOT11-201ENST00000289382 ADAMTS12P58397 1594 aa25.74■■□□□ 1.71
CNOT11-201ENST00000289382 HECW1Q76N89 1606 aa25.73■■□□□ 1.71
CNOT11-201ENST00000289382 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.72■■□□□ 1.71
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CNOT11-201ENST00000289382 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CNOT11-201ENST00000289382 WDR62O43379 1518 aa25.69■■□□□ 1.7
CNOT11-201ENST00000289382 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.67■■□□□ 1.7
CNOT11-201ENST00000289382 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.66■■□□□ 1.7
CNOT11-201ENST00000289382 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.64■■□□□ 1.7
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CNOT11-201ENST00000289382 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.63■■□□□ 1.69
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CNOT11-201ENST00000289382 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.61■■□□□ 1.69
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CNOT11-201ENST00000289382 MIA2Q96PC5 1412 aa25.58■■□□□ 1.69
CNOT11-201ENST00000289382 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
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CNOT11-201ENST00000289382 DAPK1P53355 1430 aa25.55■■□□□ 1.68
CNOT11-201ENST00000289382 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CNOT11-201ENST00000289382 KIAA0556O60303 1618 aa25.52■■□□□ 1.68
CNOT11-201ENST00000289382 FBLN2P98095 1184 aa25.51■■□□□ 1.68
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC7Q96M83 1385 aa25.51■■□□□ 1.67
CNOT11-201ENST00000289382 AKNAQ7Z591 1439 aa25.51■■□□□ 1.67
CNOT11-201ENST00000289382 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
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CNOT11-201ENST00000289382 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CNOT11-201ENST00000289382 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.5■■□□□ 1.67
CNOT11-201ENST00000289382 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
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CNOT11-201ENST00000289382 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.49■■□□□ 1.67
CNOT11-201ENST00000289382 IFT140Q96RY7 1462 aa25.49■■□□□ 1.67
CNOT11-201ENST00000289382 NCOA1Q15788 1441 aa25.49■■□□□ 1.67
CNOT11-201ENST00000289382 GRIN2AQ12879 1464 aa25.45■■□□□ 1.67
CNOT11-201ENST00000289382 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.45■■□□□ 1.66
CNOT11-201ENST00000289382 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CNOT11-201ENST00000289382 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.42■■□□□ 1.66
CNOT11-201ENST00000289382 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CNOT11-201ENST00000289382 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CNOT11-201ENST00000289382 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CNOT11-201ENST00000289382 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CNOT11-201ENST00000289382 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CNOT11-201ENST00000289382 ROCK1Q13464 1354 aa25.4■■□□□ 1.66
CNOT11-201ENST00000289382 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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CNOT11-201ENST00000289382 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.39■■□□□ 1.65
CNOT11-201ENST00000289382 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.39■■□□□ 1.65
CNOT11-201ENST00000289382 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.38■■□□□ 1.65
CNOT11-201ENST00000289382 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CNOT11-201ENST00000289382 KIF14Q15058 1648 aa25.35■■□□□ 1.65
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CNOT11-201ENST00000289382 IL27Q8NEV9 243 aa25.34■■□□□ 1.65
CNOT11-201ENST00000289382 CEP170Q5SW79 1584 aa25.34■■□□□ 1.65
CNOT11-201ENST00000289382 PZPP20742 1482 aa25.33■■□□□ 1.65
CNOT11-201ENST00000289382 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.31■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.3■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 NUDCQ9Y266 331 aa25.3■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 JPH4Q96JJ6 628 aa25.29■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.29■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 ERCC6Q03468 1493 aa25.29■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.28■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 PKD2Q13563 968 aa25.28■■□□□ 1.64
CNOT11-201ENST00000289382 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CNOT11-201ENST00000289382 SYNJ2O15056 1496 aa25.2■■□□□ 1.62
CNOT11-201ENST00000289382 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CNOT11-201ENST00000289382 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CNOT11-201ENST00000289382 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CNOT11-201ENST00000289382 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CNOT11-201ENST00000289382 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.16■■□□□ 1.62
CNOT11-201ENST00000289382 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
CNOT11-201ENST00000289382 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.14■■□□□ 1.62
CNOT11-201ENST00000289382 NEFMP07197 916 aa25.14■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.14■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.13■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 USP47Q96K76 1375 aa25.13■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.13■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.13■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 NUP155O75694 1391 aa25.12■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.12■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.12■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 USP35Q9P2H5 1018 aa25.11■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 MBD5Q9P267 1494 aa25.11■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 ATP10BO94823 1461 aa25.11■■□□□ 1.61
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CNOT11-201ENST00000289382 NUP160Q12769 1436 aa25.1■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 ADGRL2O95490 1459 aa25.09■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.08■■□□□ 1.61
CNOT11-201ENST00000289382 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.07■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.07■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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