RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ERCC6Q03468 1493 aa26.96■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 NRDCO43847 1150 aa26.96■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 MCCP23508 829 aa26.94■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.94■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.93■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.91■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.91■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 FMN1Q68DA7 1419 aa26.9■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.9■■□□□ 1.9
CCSAP-201ENST00000284617 FOXD1Q16676 465 aa26.85■■□□□ 1.89
CCSAP-201ENST00000284617 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CCSAP-201ENST00000284617 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CCSAP-201ENST00000284617 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC8Q09428 1581 aa26.83■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.82■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 NUP155O75694 1391 aa26.81■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.81■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 PTMSP20962 102 aa26.81■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 GBP4Q96PP9 640 aa26.78■■□□□ 1.88
CCSAP-201ENST00000284617 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.76■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 PDE3BQ13370 1112 aa26.74■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.73■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 GGT6Q6P531 493 aa26.72■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP13Q86W25 1043 aa26.71■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA2Q08379 1002 aa26.71■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.71■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.71■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.71■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 SOX12O15370 315 aa26.7■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.7■■□□□ 1.87
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCA2P51531 1590 aa26.7■■□□□ 1.86
CCSAP-201ENST00000284617 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.69■■□□□ 1.86
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.69■■□□□ 1.86
CCSAP-201ENST00000284617 STK26Q9P289 416 aa26.68■■□□□ 1.86
CCSAP-201ENST00000284617 NPHP1O15259 732 aa26.67■■□□□ 1.86
CCSAP-201ENST00000284617 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.66■■□□□ 1.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CCSAP-201ENST00000284617 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.63■■□□□ 1.85
CCSAP-201ENST00000284617 DRC7Q8IY82 874 aa26.62■■□□□ 1.85
CCSAP-201ENST00000284617 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.62■■□□□ 1.85
CCSAP-201ENST00000284617 APBB1O00213 710 aa26.62■■□□□ 1.85
CCSAP-201ENST00000284617 MLECQ14165 292 aa26.62■■□□□ 1.85
CCSAP-201ENST00000284617 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.62■■□□□ 1.85
CCSAP-201ENST00000284617 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CCSAP-201ENST00000284617 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.58■■□□□ 1.85
CCSAP-201ENST00000284617 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.57■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.56■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.56■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 STK31Q9BXU1 1019 aa26.54■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 HMMRO75330 724 aa26.53■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 KIF15Q9NS87 1388 aa26.53■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.53■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.52■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CCSAP-201ENST00000284617 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CCSAP-201ENST00000284617 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CCSAP-201ENST00000284617 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.51■■□□□ 1.83
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.5■■□□□ 1.83
CCSAP-201ENST00000284617 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CCSAP-201ENST00000284617 KIF3BO15066 747 aa26.49■■□□□ 1.83
CCSAP-201ENST00000284617 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.47■■□□□ 1.83
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.825e-7■■□□□ 13.3
CCSAP-201ENST00000284617 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.45■■□□□ 1.82
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.44■■□□□ 1.82
CCSAP-201ENST00000284617 GPATCH3Q96I76 525 aa26.42■■□□□ 1.82
CCSAP-201ENST00000284617 USP35Q9P2H5 1018 aa26.42■■□□□ 1.82
CCSAP-201ENST00000284617 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CCSAP-201ENST00000284617 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CCSAP-201ENST00000284617 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CCSAP-201ENST00000284617 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.39■■□□□ 1.82
CCSAP-201ENST00000284617 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.38■■□□□ 1.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.38■■□□□ 1.81
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.37■■□□□ 1.81
CCSAP-201ENST00000284617 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.37■■□□□ 1.81
CCSAP-201ENST00000284617 WIZO95785 1651 aa26.36■■□□□ 1.81
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.35■■□□□ 1.81
CCSAP-201ENST00000284617 ST18O60284 1047 aa26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms