RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 DAPK1P53355 1430 aa16.11■□□□□ 0.17
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GGPS1-201ENST00000282841 KDM6BO15054 1643 aa16.1■□□□□ 0.17
GGPS1-201ENST00000282841 HFM1A2PYH4 1435 aa16.09■□□□□ 0.17
GGPS1-201ENST00000282841 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
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GGPS1-201ENST00000282841 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.07■□□□□ 0.16
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GGPS1-201ENST00000282841 MIER1Q8N108 512 aa15.67■□□□□ 0.1
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GGPS1-201ENST00000282841 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.64■□□□□ 0.09
GGPS1-201ENST00000282841 PLXNC1O60486 1568 aa15.63■□□□□ 0.09
GGPS1-201ENST00000282841 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
GGPS1-201ENST00000282841 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.61■□□□□ 0.09
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.59■□□□□ 0.09
GGPS1-201ENST00000282841 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.59■□□□□ 0.09
GGPS1-201ENST00000282841 ERBINQ96RT1 1412 aa15.59■□□□□ 0.09
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