RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269385.8

CBX8-201, Transcript of chromobox 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX8, Length 3,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8-201ENST00000269385 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 DISP1Q96F81 1524 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 ZMYND15Q9H091 742 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 KIAA0556O60303 1618 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.03■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.03■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 KDM6BO15054 1643 aa22.03■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 NCOA2Q15596 1464 aa22.02■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 HECW1Q76N89 1606 aa22.02■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 P3H3Q8IVL6 736 aa22.01■■□□□ 1.11
CBX8-201ENST00000269385 IFT140Q96RY7 1462 aa22■■□□□ 1.11
CBX8-201ENST00000269385 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CBX8-201ENST00000269385 CEP170Q5SW79 1584 aa21.99■■□□□ 1.11
CBX8-201ENST00000269385 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CBX8-201ENST00000269385 HFM1A2PYH4 1435 aa21.94■■□□□ 1.1
CBX8-201ENST00000269385 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.93■■□□□ 1.1
CBX8-201ENST00000269385 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CBX8-201ENST00000269385 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.93■■□□□ 1.1
CBX8-201ENST00000269385 NAIPQ13075 1403 aa21.9■■□□□ 1.1
CBX8-201ENST00000269385 GRIN2AQ12879 1464 aa21.89■■□□□ 1.09
CBX8-201ENST00000269385 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.88■■□□□ 1.09
CBX8-201ENST00000269385 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CBX8-201ENST00000269385 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.87■■□□□ 1.09
CBX8-201ENST00000269385 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CBX8-201ENST00000269385 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CBX8-201ENST00000269385 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.86■■□□□ 1.09
CBX8-201ENST00000269385 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CBX8-201ENST00000269385 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CBX8-201ENST00000269385 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.81■■□□□ 1.08
CBX8-201ENST00000269385 USP35Q9P2H5 1018 aa21.8■■□□□ 1.08
CBX8-201ENST00000269385 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CBX8-201ENST00000269385 AKNAQ7Z591 1439 aa21.79■■□□□ 1.08
CBX8-201ENST00000269385 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CBX8-201ENST00000269385 GSE1Q14687 1217 aa21.76■■□□□ 1.07
CBX8-201ENST00000269385 NUP160Q12769 1436 aa21.76■■□□□ 1.07
CBX8-201ENST00000269385 UACAQ9BZF9 1416 aa21.76■■□□□ 1.07
CBX8-201ENST00000269385 KIF14Q15058 1648 aa21.74■■□□□ 1.07
CBX8-201ENST00000269385 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CBX8-201ENST00000269385 SYNJ2O15056 1496 aa21.71■■□□□ 1.07
CBX8-201ENST00000269385 MIA2Q96PC5 1412 aa21.71■■□□□ 1.07
CBX8-201ENST00000269385 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.7■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 CCER2I3L3R5 266 aa21.7■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 ABCA8O94911 1581 aa21.7■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.69■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.69■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 ARXQ96QS3 562 aa21.68■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.66■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CBX8-201ENST00000269385 PDE4CQ08493 712 aa21.62■■□□□ 1.05
CBX8-201ENST00000269385 SHROOM2Q13796 1616 aa21.62■■□□□ 1.05
CBX8-201ENST00000269385 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.61■■□□□ 1.05
CBX8-201ENST00000269385 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX8-201ENST00000269385 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX8-201ENST00000269385 ABCC5O15440 1437 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX8-201ENST00000269385 DAPK1P53355 1430 aa21.58■■□□□ 1.05
CBX8-201ENST00000269385 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.58■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 CHD1O14646 1710 aa21.57■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.56■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.56■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 ROCK1Q13464 1354 aa21.54■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 ADGRL2O95490 1459 aa21.52■■□□□ 1.04
CBX8-201ENST00000269385 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.51■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.51■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.49■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.49■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 PZPP20742 1482 aa21.49■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CBX8-201ENST00000269385 MBD5Q9P267 1494 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX8-201ENST00000269385 NFKBIBQ15653 356 aa21.43■■□□□ 1.02
CBX8-201ENST00000269385 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CBX8-201ENST00000269385 ATP10BO94823 1461 aa21.42■■□□□ 1.02
CBX8-201ENST00000269385 PREX2Q70Z35 1606 aa21.4■■□□□ 1.02
CBX8-201ENST00000269385 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CBX8-201ENST00000269385 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.39■■□□□ 1.01
CBX8-201ENST00000269385 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.38■■□□□ 1.01
CBX8-201ENST00000269385 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.38■■□□□ 1.01
CBX8-201ENST00000269385 SLC4A3P48751 1232 aa21.37■■□□□ 1.01
CBX8-201ENST00000269385 NCOA1Q15788 1441 aa21.37■■□□□ 1.01
CBX8-201ENST00000269385 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.37■■□□□ 1.01
CBX8-201ENST00000269385 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.35■■□□□ 1.01
CBX8-201ENST00000269385 MRS2Q9HD23 443 aa21.35■■□□□ 1.01
CBX8-201ENST00000269385 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms