RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267935.12

COMMD4-201, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COMMD4, Length 1,067 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-201ENST00000267935 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.28■■□□□ 1.32
COMMD4-201ENST00000267935 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.27■■□□□ 1.32
COMMD4-201ENST00000267935 HECW1Q76N89 1606 aa23.26■■□□□ 1.31
COMMD4-201ENST00000267935 CLIP1P30622 1438 aa23.25■■□□□ 1.31
COMMD4-201ENST00000267935 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.25■■□□□ 1.31
COMMD4-201ENST00000267935 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.25■■□□□ 1.31
COMMD4-201ENST00000267935 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
COMMD4-201ENST00000267935 ATP10AO60312 1499 aa23.22■■□□□ 1.31
COMMD4-201ENST00000267935 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
COMMD4-201ENST00000267935 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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COMMD4-201ENST00000267935 AFAP1Q8N556 730 aa23.18■■□□□ 1.3
COMMD4-201ENST00000267935 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.16■■□□□ 1.3
COMMD4-201ENST00000267935 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.16■■□□□ 1.3
COMMD4-201ENST00000267935 KIF14Q15058 1648 aa23.15■■□□□ 1.3
COMMD4-201ENST00000267935 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.15■■□□□ 1.3
COMMD4-201ENST00000267935 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.15■■□□□ 1.3
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COMMD4-201ENST00000267935 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.06■■□□□ 1.28
COMMD4-201ENST00000267935 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.05■■□□□ 1.28
COMMD4-201ENST00000267935 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.03■■□□□ 1.28
COMMD4-201ENST00000267935 CERKQ8TCT0 537 aa23.02■■□□□ 1.28
COMMD4-201ENST00000267935 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.02■■□□□ 1.28
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COMMD4-201ENST00000267935 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.96■■□□□ 1.27
COMMD4-201ENST00000267935 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.96■■□□□ 1.27
COMMD4-201ENST00000267935 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.96■■□□□ 1.27
COMMD4-201ENST00000267935 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.94■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.94■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 REREQ9P2R6 1566 aa22.93■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.93■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.92■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 PREX2Q70Z35 1606 aa22.92■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 ABCC1P33527 1531 aa22.91■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 AGLP35573 1532 aa22.91■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.9■■□□□ 1.26
COMMD4-201ENST00000267935 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.87■■□□□ 1.25
COMMD4-201ENST00000267935 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.86■■□□□ 1.25
COMMD4-201ENST00000267935 ABCA6Q8N139 1617 aa22.86■■□□□ 1.25
COMMD4-201ENST00000267935 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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COMMD4-201ENST00000267935 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.84■■□□□ 1.25
COMMD4-201ENST00000267935 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.83■■□□□ 1.25
COMMD4-201ENST00000267935 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.83■■□□□ 1.25
COMMD4-201ENST00000267935 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.81■■□□□ 1.24
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COMMD4-201ENST00000267935 ZMYM3Q14202 1370 aa22.79■■□□□ 1.24
COMMD4-201ENST00000267935 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.79■■□□□ 1.24
COMMD4-201ENST00000267935 PTPRTO14522 1441 aa22.79■■□□□ 1.24
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COMMD4-201ENST00000267935 GGT6Q6P531 493 aa22.77■■□□□ 1.24
COMMD4-201ENST00000267935 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
COMMD4-201ENST00000267935 NPATQ14207 1427 aa22.75■■□□□ 1.23
COMMD4-201ENST00000267935 STRCQ7RTU9 1775 aa22.75■■□□□ 1.23
COMMD4-201ENST00000267935 A2MP01023 1474 aa22.73■■□□□ 1.23
COMMD4-201ENST00000267935 ATP7AQ04656 1500 aa22.71■■□□□ 1.23
COMMD4-201ENST00000267935 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.7■■□□□ 1.22
COMMD4-201ENST00000267935 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
COMMD4-201ENST00000267935 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
COMMD4-201ENST00000267935 NCOA1Q15788 1441 aa22.67■■□□□ 1.22
COMMD4-201ENST00000267935 PKD2Q13563 968 aa22.67■■□□□ 1.22
COMMD4-201ENST00000267935 MROH2AA6NES4 1674 aa22.66■■□□□ 1.22
COMMD4-201ENST00000267935 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.65■■□□□ 1.22
COMMD4-201ENST00000267935 CEP162Q5TB80 1403 aa22.64■■□□□ 1.21
COMMD4-201ENST00000267935 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.63■■□□□ 1.21
COMMD4-201ENST00000267935 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.62■■□□□ 1.21
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COMMD4-201ENST00000267935 TSPY4P0CV99 314 aa22.61■■□□□ 1.21
COMMD4-201ENST00000267935 TSPY10P0CW01 314 aa22.61■■□□□ 1.21
COMMD4-201ENST00000267935 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
COMMD4-201ENST00000267935 KIF3BO15066 747 aa22.6■■□□□ 1.21
COMMD4-201ENST00000267935 MBD5Q9P267 1494 aa22.6■■□□□ 1.21
COMMD4-201ENST00000267935 PLXNC1O60486 1568 aa22.59■■□□□ 1.21
COMMD4-201ENST00000267935 PTPRKQ15262 1439 aa22.59■■□□□ 1.21
COMMD4-201ENST00000267935 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.58■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.58■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.57■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 TIAM1Q13009 1591 aa22.57■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.55■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 PLA2R1Q13018 1463 aa22.54■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.54■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 NCOA2Q15596 1464 aa22.52■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.52■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
COMMD4-201ENST00000267935 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.51■■□□□ 1.19
COMMD4-201ENST00000267935 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
COMMD4-201ENST00000267935 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
COMMD4-201ENST00000267935 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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