RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 FOXD1Q16676 465 aa20.61■□□□□ 0.89
SYP-201ENST00000263233 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SYP-201ENST00000263233 IQGAP2Q13576 1575 aa20.6■□□□□ 0.89
SYP-201ENST00000263233 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.6■□□□□ 0.89
SYP-201ENST00000263233 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SYP-201ENST00000263233 FBLN2P98095 1184 aa20.59■□□□□ 0.89
SYP-201ENST00000263233 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.58■□□□□ 0.89
SYP-201ENST00000263233 PBRM1Q86U86 1689 aa20.58■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 IFT140Q96RY7 1462 aa20.58■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.57■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.56■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.56■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 DAPK1P53355 1430 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 ROCK1Q13464 1354 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 ARID3CA6NKF2 412 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 MRS2Q9HD23 443 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 ADAMTS12P58397 1594 aa20.52■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.52■□□□□ 0.88
SYP-201ENST00000263233 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.52■□□□□ 0.87
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SYP-201ENST00000263233 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SYP-201ENST00000263233 ABCC5O15440 1437 aa20.5■□□□□ 0.87
SYP-201ENST00000263233 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.5■□□□□ 0.87
SYP-201ENST00000263233 BCL11AQ9H165 835 aa20.49■□□□□ 0.87
SYP-201ENST00000263233 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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SYP-201ENST00000263233 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.42■□□□□ 0.86
SYP-201ENST00000263233 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
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SYP-201ENST00000263233 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
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SYP-201ENST00000263233 DISP1Q96F81 1524 aa20.38■□□□□ 0.85
SYP-201ENST00000263233 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.37■□□□□ 0.85
SYP-201ENST00000263233 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SYP-201ENST00000263233 MBD5Q9P267 1494 aa20.37■□□□□ 0.85
SYP-201ENST00000263233 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.36■□□□□ 0.85
SYP-201ENST00000263233 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-201ENST00000263233 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SYP-201ENST00000263233 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.33■□□□□ 0.84
SYP-201ENST00000263233 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-201ENST00000263233 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-201ENST00000263233 USP47Q96K76 1375 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-201ENST00000263233 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-201ENST00000263233 KIF14Q15058 1648 aa20.29■□□□□ 0.84
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SYP-201ENST00000263233 KDM5CP41229 1560 aa20.28■□□□□ 0.84
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SYP-201ENST00000263233 NUDCQ9Y266 331 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-201ENST00000263233 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-201ENST00000263233 ADGRL2O95490 1459 aa20.27■□□□□ 0.83
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SYP-201ENST00000263233 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYP-201ENST00000263233 CEP170Q5SW79 1584 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-201ENST00000263233 PKD2Q13563 968 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-201ENST00000263233 SYNJ2O15056 1496 aa20.23■□□□□ 0.83
SYP-201ENST00000263233 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SYP-201ENST00000263233 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.21■□□□□ 0.83
SYP-201ENST00000263233 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.2■□□□□ 0.82
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SYP-201ENST00000263233 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.19■□□□□ 0.82
SYP-201ENST00000263233 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.19■□□□□ 0.82
SYP-201ENST00000263233 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SYP-201ENST00000263233 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.18■□□□□ 0.82
SYP-201ENST00000263233 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.17■□□□□ 0.82
SYP-201ENST00000263233 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.16■□□□□ 0.82
SYP-201ENST00000263233 CHD1O14646 1710 aa20.16■□□□□ 0.82
SYP-201ENST00000263233 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.15■□□□□ 0.82
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SYP-201ENST00000263233 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.13■□□□□ 0.81
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SYP-201ENST00000263233 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
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SYP-201ENST00000263233 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.08■□□□□ 0.81
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SYP-201ENST00000263233 NUP160Q12769 1436 aa20.08■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.08■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 E9PCH4 1651 aa20.07■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.07■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.05■□□□□ 0.8
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