RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 GRIN2AQ12879 1464 aa25.39■■□□□ 1.66
PANX1-201ENST00000227638 CCER2I3L3R5 266 aa25.39■■□□□ 1.66
PANX1-201ENST00000227638 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.37■■□□□ 1.65
PANX1-201ENST00000227638 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PANX1-201ENST00000227638 NEFLP07196 543 aa25.35■■□□□ 1.65
PANX1-201ENST00000227638 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.35■■□□□ 1.65
PANX1-201ENST00000227638 KIAA0556O60303 1618 aa25.34■■□□□ 1.65
PANX1-201ENST00000227638 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
PANX1-201ENST00000227638 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.33■■□□□ 1.64
PANX1-201ENST00000227638 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PANX1-201ENST00000227638 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.3■■□□□ 1.64
PANX1-201ENST00000227638 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
PANX1-201ENST00000227638 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.28■■□□□ 1.64
PANX1-201ENST00000227638 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PANX1-201ENST00000227638 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PANX1-201ENST00000227638 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PANX1-201ENST00000227638 CEP170Q5SW79 1584 aa25.25■■□□□ 1.63
PANX1-201ENST00000227638 JPH4Q96JJ6 628 aa25.23■■□□□ 1.63
PANX1-201ENST00000227638 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.21■■□□□ 1.63
PANX1-201ENST00000227638 MIA2Q96PC5 1412 aa25.2■■□□□ 1.62
PANX1-201ENST00000227638 SYNJ2O15056 1496 aa25.19■■□□□ 1.62
PANX1-201ENST00000227638 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.19■■□□□ 1.62
PANX1-201ENST00000227638 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PANX1-201ENST00000227638 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PANX1-201ENST00000227638 ABCC5O15440 1437 aa25.16■■□□□ 1.62
PANX1-201ENST00000227638 DAPK1P53355 1430 aa25.16■■□□□ 1.62
PANX1-201ENST00000227638 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PANX1-201ENST00000227638 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PANX1-201ENST00000227638 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.14■■□□□ 1.61
PANX1-201ENST00000227638 MRS2Q9HD23 443 aa25.13■■□□□ 1.61
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.12■■□□□ 1.61
PANX1-201ENST00000227638 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PANX1-201ENST00000227638 CCDC7Q96M83 1385 aa25.09■■□□□ 1.61
PANX1-201ENST00000227638 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.08■■□□□ 1.61
PANX1-201ENST00000227638 KIF14Q15058 1648 aa25.08■■□□□ 1.61
PANX1-201ENST00000227638 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PANX1-201ENST00000227638 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.05■■□□□ 1.6
PANX1-201ENST00000227638 PKD2Q13563 968 aa25.04■■□□□ 1.6
PANX1-201ENST00000227638 NUP160Q12769 1436 aa25.04■■□□□ 1.6
PANX1-201ENST00000227638 AKNAQ7Z591 1439 aa25.03■■□□□ 1.6
PANX1-201ENST00000227638 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.03■■□□□ 1.6
PANX1-201ENST00000227638 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.03■■□□□ 1.6
PANX1-201ENST00000227638 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PANX1-201ENST00000227638 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.02■■□□□ 1.6
PANX1-201ENST00000227638 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PANX1-201ENST00000227638 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.99■■□□□ 1.59
PANX1-201ENST00000227638 NCOA1Q15788 1441 aa24.98■■□□□ 1.59
PANX1-201ENST00000227638 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PANX1-201ENST00000227638 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.98■■□□□ 1.59
PANX1-201ENST00000227638 ROCK1Q13464 1354 aa24.97■■□□□ 1.59
PANX1-201ENST00000227638 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.96■■□□□ 1.59
PANX1-201ENST00000227638 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
PANX1-201ENST00000227638 ATP10BO94823 1461 aa24.92■■□□□ 1.58
PANX1-201ENST00000227638 PZPP20742 1482 aa24.92■■□□□ 1.58
PANX1-201ENST00000227638 MSH5O43196 834 aa24.91■■□□□ 1.58
PANX1-201ENST00000227638 BCL11AQ9H165 835 aa24.9■■□□□ 1.58
PANX1-201ENST00000227638 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.88■■□□□ 1.57
PANX1-201ENST00000227638 NUP155O75694 1391 aa24.85■■□□□ 1.57
PANX1-201ENST00000227638 USP47Q96K76 1375 aa24.85■■□□□ 1.57
PANX1-201ENST00000227638 PTPRGP23470 1445 aa24.85■■□□□ 1.57
PANX1-201ENST00000227638 ABCA8O94911 1581 aa24.85■■□□□ 1.57
PANX1-201ENST00000227638 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PANX1-201ENST00000227638 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.84■■□□□ 1.57
PANX1-201ENST00000227638 RGL3Q3MIN7 710 aa24.81■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.81■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.8■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.8■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.8■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.8■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.78■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.78■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.78■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 TSPY4P0CV99 314 aa24.77■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 TSPY10P0CW01 314 aa24.77■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.77■■□□□ 1.56
PANX1-201ENST00000227638 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.75■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.75■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.74■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 CHD1O14646 1710 aa24.74■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.74■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.72■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.72■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.72■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 ADGRL2O95490 1459 aa24.71■■□□□ 1.55
PANX1-201ENST00000227638 TMC1Q8TDI8 760 aa24.67■■□□□ 1.54
PANX1-201ENST00000227638 KIF15Q9NS87 1388 aa24.67■■□□□ 1.54
PANX1-201ENST00000227638 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.67■■□□□ 1.54
PANX1-201ENST00000227638 MBD5Q9P267 1494 aa24.63■■□□□ 1.53
PANX1-201ENST00000227638 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PANX1-201ENST00000227638 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.59■■□□□ 1.53
PANX1-201ENST00000227638 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.58■■□□□ 1.53
PANX1-201ENST00000227638 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.55■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 NUDCQ9Y266 331 aa24.54■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.54■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.54■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.54■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms