RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000201262.1

Gm42854-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm42854, Length 722 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42854-201ENSMUST00000201262 A2mQ6GQT1 1474 aa23.19■■□□□ 1.3
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Gm42854-201ENSMUST00000201262 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
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Gm42854-201ENSMUST00000201262 Kiaa0556Q8C753 1610 aa22.97■■□□□ 1.27
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Gm42854-201ENSMUST00000201262 Tiam1Q60610 1591 aa22.93■■□□□ 1.26
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Gm42854-201ENSMUST00000201262 Synj2Q9D2G5 1434 aa22.9■■□□□ 1.26
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Trappc8E9PWG2 1437 aa22.89■■□□□ 1.25
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa22.89■■□□□ 1.25
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Gm42854-201ENSMUST00000201262 Adcy10Q8C0T9 1614 aa22.85■■□□□ 1.25
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Ptch1Q61115 1434 aa22.84■■□□□ 1.25
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Tdrd9Q14BI7 1383 aa22.84■■□□□ 1.25
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa22.82■■□□□ 1.24
Gm42854-201ENSMUST00000201262 OvosQ3UU35 1456 aa22.82■■□□□ 1.24
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa22.81■■□□□ 1.24
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Lemd3Q9WU40 921 aa22.8■■□□□ 1.24
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Abcc3B2RX12 1523 aa22.8■■□□□ 1.24
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Dip2cE9PWR4 1557 aa22.79■■□□□ 1.24
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa22.79■■□□□ 1.24
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Kdm5cP41230 1554 aa22.78■■□□□ 1.24
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Brwd3A2AHJ4 1799 aa22.76■■□□□ 1.23
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Ccnb3Q810T2 1396 aa22.76■■□□□ 1.23
Gm42854-201ENSMUST00000201262 RereQ80TZ9 1558 aa22.75■■□□□ 1.23
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa22.73■■□□□ 1.23
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa22.72■■□□□ 1.23
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Atp10aO54827 1508 aa22.72■■□□□ 1.23
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Cfap74Q3UY96 1578 aa22.7■■□□□ 1.22
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Caskin1Q6P9K8 1431 aa22.69■■□□□ 1.22
Gm42854-201ENSMUST00000201262 NpatQ8BMA5 1420 aa22.67■■□□□ 1.22
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Neurl4Q5NCX5 1563 aa22.66■■□□□ 1.22
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Cfap65Q3V0B4 1847 aa22.64■■□□□ 1.22
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Hecw1Q8K4P8 1604 aa22.57■■□□□ 1.2
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Map3k5O35099 1380 aa22.57■■□□□ 1.2
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Cyb5rlB1AS42 316 aa22.55■■□□□ 1.2
Gm42854-201ENSMUST00000201262 PtprmP28828 1452 aa22.54■■□□□ 1.2
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Camsap2Q8C1B1 1461 aa22.54■■□□□ 1.2
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Nos1Q9Z0J4 1429 aa22.48■■□□□ 1.19
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa22.47■■□□□ 1.19
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Trpm1Q2TV84 1622 aa22.47■■□□□ 1.19
Gm42854-201ENSMUST00000201262 MyclP10166 368 aa22.47■■□□□ 1.19
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa22.46■■□□□ 1.19
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Gm42854-201ENSMUST00000201262 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa22.45■■□□□ 1.18
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Gm42854-201ENSMUST00000201262 Fhod3Q76LL6 1578 aa22.44■■□□□ 1.18
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Afap1Q80YS6 731 aa22.43■■□□□ 1.18
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa22.41■■□□□ 1.18
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Gm42854-201ENSMUST00000201262 Abca6Q8K441 1624 aa22.39■■□□□ 1.18
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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Gm42854-201ENSMUST00000201262 Gli2Q0VGT2 1544 aa22.38■■□□□ 1.17
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Gm42854-201ENSMUST00000201262 Myom2Q14BI5 1463 aa22.35■■□□□ 1.17
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Cabp1Q9JLK7 227 aa22.35■■□□□ 1.17
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Mtus2Q3UHD3 1353 aa22.33■■□□□ 1.17
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Talpid3E9PV87 1520 aa22.32■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Fmn2Q9JL04 1578 aa22.32■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa22.31■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Plekhh2Q8C115 1491 aa22.31■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa22.31■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Prdm16A2A935 1275 aa22.3■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Abca17E9PX95 1733 aa22.29■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Chic2Q9D9G3 165 aa22.29■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Dip2bQ3UH60 1574 aa22.29■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Kif3bQ61771 747 aa22.28■■□□□ 1.16
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Trpm2Q91YD4 1506 aa22.26■■□□□ 1.15
Gm42854-201ENSMUST00000201262 RictorQ6QI06 1708 aa22.26■■□□□ 1.15
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa22.26■■□□□ 1.15
Gm42854-201ENSMUST00000201262 Uggt2E9Q4X2 1504 aa22.25■■□□□ 1.15
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