RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000178155.8

Smim22-201, Transcript of MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smim22, Length 429 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22-201ENSMUST00000178155 Plppr3Q7TPB0 716 aa28.27■■■□□ 2.12
Smim22-201ENSMUST00000178155 Mug1P28665 1476 aa28.25■■■□□ 2.11
Smim22-201ENSMUST00000178155 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa28.23■■■□□ 2.11
Smim22-201ENSMUST00000178155 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Smim22-201ENSMUST00000178155 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa28.2■■■□□ 2.11
Smim22-201ENSMUST00000178155 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa28.2■■■□□ 2.1
Smim22-201ENSMUST00000178155 Rnf17Q99MV7 1640 aa28.2■■■□□ 2.1
Smim22-201ENSMUST00000178155 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
Smim22-201ENSMUST00000178155 Abca9Q8K449 1623 aa28.18■■■□□ 2.1
Smim22-201ENSMUST00000178155 CntlnA2AM05 1397 aa28.17■■■□□ 2.1
Smim22-201ENSMUST00000178155 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa28.09■■■□□ 2.09
Smim22-201ENSMUST00000178155 Kiaa0556Q8C753 1610 aa28.07■■■□□ 2.08
Smim22-201ENSMUST00000178155 Lmod2Q3UHZ5 550 aa28.05■■■□□ 2.08
Smim22-201ENSMUST00000178155 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28.03■■■□□ 2.08
Smim22-201ENSMUST00000178155 Synj2Q9D2G5 1434 aa28.01■■■□□ 2.07
Smim22-201ENSMUST00000178155 Peg3Q3URU2 1571 aa27.99■■■□□ 2.07
Smim22-201ENSMUST00000178155 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa27.96■■■□□ 2.07
Smim22-201ENSMUST00000178155 Naip1Q9QWK5 1403 aa27.96■■■□□ 2.07
Smim22-201ENSMUST00000178155 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
Smim22-201ENSMUST00000178155 Arhgap5P97393 1501 aa27.96■■■□□ 2.07
Smim22-201ENSMUST00000178155 NexmifQ5DTT1 1515 aa27.96■■■□□ 2.07
Smim22-201ENSMUST00000178155 Qser1A2BIE1 1698 aa27.94■■■□□ 2.06
Smim22-201ENSMUST00000178155 Naip2Q9QUK4 1447 aa27.93■■■□□ 2.06
Smim22-201ENSMUST00000178155 Kidins220E9Q9B7 1793 aa27.93■■■□□ 2.06
Smim22-201ENSMUST00000178155 Cul9Q80TT8 1865 aa27.9■■■□□ 2.06
Smim22-201ENSMUST00000178155 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa27.9■■■□□ 2.06
Smim22-201ENSMUST00000178155 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
Smim22-201ENSMUST00000178155 Tiam1Q60610 1591 aa27.89■■■□□ 2.05
Smim22-201ENSMUST00000178155 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
Smim22-201ENSMUST00000178155 Lemd3Q9WU40 921 aa27.88■■■□□ 2.05
Smim22-201ENSMUST00000178155 OvosQ3UU35 1456 aa27.86■■■□□ 2.05
Smim22-201ENSMUST00000178155 Trappc8E9PWG2 1437 aa27.84■■■□□ 2.05
Smim22-201ENSMUST00000178155 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa27.81■■■□□ 2.04
Smim22-201ENSMUST00000178155 Brwd3A2AHJ4 1799 aa27.81■■■□□ 2.04
Smim22-201ENSMUST00000178155 Tdrd9Q14BI7 1383 aa27.8■■■□□ 2.04
Smim22-201ENSMUST00000178155 Ptch1Q61115 1434 aa27.8■■■□□ 2.04
Smim22-201ENSMUST00000178155 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa27.79■■■□□ 2.04
Smim22-201ENSMUST00000178155 Adcy10Q8C0T9 1614 aa27.79■■■□□ 2.04
Smim22-201ENSMUST00000178155 Abcc3B2RX12 1523 aa27.79■■■□□ 2.04
Smim22-201ENSMUST00000178155 Yeats2Q3TUF7 1407 aa27.79■■■□□ 2.04
Smim22-201ENSMUST00000178155 Kdm5cP41230 1554 aa27.78■■■□□ 2.04
Smim22-201ENSMUST00000178155 Dip2cE9PWR4 1557 aa27.74■■■□□ 2.03
Smim22-201ENSMUST00000178155 Atp10aO54827 1508 aa27.74■■■□□ 2.03
Smim22-201ENSMUST00000178155 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa27.73■■■□□ 2.03
Smim22-201ENSMUST00000178155 Cfap74Q3UY96 1578 aa27.73■■■□□ 2.03
Smim22-201ENSMUST00000178155 Caskin1Q6P9K8 1431 aa27.72■■■□□ 2.03
Smim22-201ENSMUST00000178155 RereQ80TZ9 1558 aa27.72■■■□□ 2.03
Smim22-201ENSMUST00000178155 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa27.7■■■□□ 2.02
Smim22-201ENSMUST00000178155 Ccnb3Q810T2 1396 aa27.69■■■□□ 2.02
Smim22-201ENSMUST00000178155 NpatQ8BMA5 1420 aa27.68■■■□□ 2.02
Smim22-201ENSMUST00000178155 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
Smim22-201ENSMUST00000178155 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa27.64■■■□□ 2.02
Smim22-201ENSMUST00000178155 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
Smim22-201ENSMUST00000178155 Cyb5rlB1AS42 316 aa27.63■■■□□ 2.01
Smim22-201ENSMUST00000178155 Neurl4Q5NCX5 1563 aa27.62■■■□□ 2.01
Smim22-201ENSMUST00000178155 Cfap65Q3V0B4 1847 aa27.59■■■□□ 2.01
Smim22-201ENSMUST00000178155 Camsap2Q8C1B1 1461 aa27.53■■■□□ 2
Smim22-201ENSMUST00000178155 PtprmP28828 1452 aa27.52■■■□□ 2
Smim22-201ENSMUST00000178155 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
Smim22-201ENSMUST00000178155 Hecw1Q8K4P8 1604 aa27.52■■■□□ 2
Smim22-201ENSMUST00000178155 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
Smim22-201ENSMUST00000178155 MyclP10166 368 aa27.46■■□□□ 1.99
Smim22-201ENSMUST00000178155 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa27.46■■□□□ 1.99
Smim22-201ENSMUST00000178155 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
Smim22-201ENSMUST00000178155 Map3k5O35099 1380 aa27.45■■□□□ 1.98
Smim22-201ENSMUST00000178155 Nos1Q9Z0J4 1429 aa27.41■■□□□ 1.98
Smim22-201ENSMUST00000178155 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa27.41■■□□□ 1.98
Smim22-201ENSMUST00000178155 Trpm1Q2TV84 1622 aa27.41■■□□□ 1.98
Smim22-201ENSMUST00000178155 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa27.38■■□□□ 1.97
Smim22-201ENSMUST00000178155 Fhod3Q76LL6 1578 aa27.37■■□□□ 1.97
Smim22-201ENSMUST00000178155 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Smim22-201ENSMUST00000178155 Afap1Q80YS6 731 aa27.35■■□□□ 1.97
Smim22-201ENSMUST00000178155 Talpid3E9PV87 1520 aa27.34■■□□□ 1.97
Smim22-201ENSMUST00000178155 Abca6Q8K441 1624 aa27.33■■□□□ 1.97
Smim22-201ENSMUST00000178155 Abcc5Q9R1X5 1436 aa27.32■■□□□ 1.96
Smim22-201ENSMUST00000178155 Mast1Q9R1L5 1570 aa27.31■■□□□ 1.96
Smim22-201ENSMUST00000178155 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Smim22-201ENSMUST00000178155 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Smim22-201ENSMUST00000178155 Naip6Q9JIB6 1403 aa27.3■■□□□ 1.96
Smim22-201ENSMUST00000178155 Gli2Q0VGT2 1544 aa27.29■■□□□ 1.96
Smim22-201ENSMUST00000178155 SphkapQ6NSW3 1687 aa27.29■■□□□ 1.96
Smim22-201ENSMUST00000178155 Myom2Q14BI5 1463 aa27.28■■□□□ 1.96
Smim22-201ENSMUST00000178155 Prdm16A2A935 1275 aa27.28■■□□□ 1.96
Smim22-201ENSMUST00000178155 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Smim22-201ENSMUST00000178155 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa27.24■■□□□ 1.95
Smim22-201ENSMUST00000178155 Fmn2Q9JL04 1578 aa27.24■■□□□ 1.95
Smim22-201ENSMUST00000178155 Mtus2Q3UHD3 1353 aa27.23■■□□□ 1.95
Smim22-201ENSMUST00000178155 Plekhh2Q8C115 1491 aa27.19■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 Cabp1Q9JLK7 227 aa27.19■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa27.18■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 Trpm2Q91YD4 1506 aa27.17■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 Kif3bQ61771 747 aa27.17■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 Dip2bQ3UH60 1574 aa27.17■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 Abca17E9PX95 1733 aa27.16■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 RictorQ6QI06 1708 aa27.16■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 Uggt2E9Q4X2 1504 aa27.14■■□□□ 1.94
Smim22-201ENSMUST00000178155 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa27.12■■□□□ 1.93
Smim22-201ENSMUST00000178155 Il16O54824 1322 aa27.11■■□□□ 1.93
Smim22-201ENSMUST00000178155 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.5 ms