RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000087467.11

Homer3-202, Transcript of Homer protein homolog 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Homer3, Length 880 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer3-202ENSMUST00000087467 Pcf11G3X9Z4 1553 aa42,5■■■■■ 4,39
Homer3-202ENSMUST00000087467 Rnf17Q99MV7 1640 aa42,46■■■■■ 4,39
Homer3-202ENSMUST00000087467 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa42,42■■■■■ 4,38
Homer3-202ENSMUST00000087467 Mug1P28665 1476 aa42,39■■■■■ 4,38
Homer3-202ENSMUST00000087467 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP42,38■■■■■ 4,37
Homer3-202ENSMUST00000087467 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP42,35■■■■■ 4,37
Homer3-202ENSMUST00000087467 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP42,28■■■■■ 4,36
Homer3-202ENSMUST00000087467 Abca9Q8K449 1623 aa42,28■■■■■ 4,36
Homer3-202ENSMUST00000087467 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa42,25■■■■■ 4,35
Homer3-202ENSMUST00000087467 CntlnA2AM05 1397 aa42,21■■■■■ 4,35
Homer3-202ENSMUST00000087467 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa42,2■■■■■ 4,35
Homer3-202ENSMUST00000087467 Lmod2Q3UHZ5 550 aa42,17■■■■■ 4,34
Homer3-202ENSMUST00000087467 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa42,16■■■■■ 4,34
Homer3-202ENSMUST00000087467 Synj2Q9D2G5 1434 aa42,15■■■■■ 4,34
Homer3-202ENSMUST00000087467 Hecw2Q6I6G8 1578 aa42,13■■■■■ 4,33
Homer3-202ENSMUST00000087467 Naip2Q9QUK4 1447 aa42,12■■■■■ 4,33
Homer3-202ENSMUST00000087467 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa42,07■■■■■ 4,33
Homer3-202ENSMUST00000087467 Kiaa0556Q8C753 1610 aa42,06■■■■■ 4,32
Homer3-202ENSMUST00000087467 Arhgap5P97393 1501 aa42,05■■■■■ 4,32
Homer3-202ENSMUST00000087467 Lemd3Q9WU40 921 aa41,98■■■■■ 4,31
Homer3-202ENSMUST00000087467 Qser1A2BIE1 1698 aa41,96■■■■■ 4,31
Homer3-202ENSMUST00000087467 NexmifQ5DTT1 1515 aa41,94■■■■■ 4,3
Homer3-202ENSMUST00000087467 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa41,92■■■■■ 4,3
Homer3-202ENSMUST00000087467 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP41,92■■■■■ 4,3
Homer3-202ENSMUST00000087467 OvosQ3UU35 1456 aa41,92■■■■■ 4,3
Homer3-202ENSMUST00000087467 Naip1Q9QWK5 1403 aa41,87■■■■■ 4,29
Homer3-202ENSMUST00000087467 Cyb5rlB1AS42 316 aa41,87■■■■■ 4,29
Homer3-202ENSMUST00000087467 Brwd3A2AHJ4 1799 aa41,86■■■■■ 4,29
Homer3-202ENSMUST00000087467 Peg3Q3URU2 1571 aa41,85■■■■■ 4,29
Homer3-202ENSMUST00000087467 Ptch1Q61115 1434 aa41,84■■■■■ 4,29
Homer3-202ENSMUST00000087467 Kidins220E9Q9B7 1793 aa41,83■■■■■ 4,29
Homer3-202ENSMUST00000087467 Yeats2Q3TUF7 1407 aa41,83■■■■■ 4,29
Homer3-202ENSMUST00000087467 Trappc8E9PWG2 1437 aa41,8■■■■■ 4,28
Homer3-202ENSMUST00000087467 Tiam1Q60610 1591 aa41,78■■■■■ 4,28
Homer3-202ENSMUST00000087467 Tdrd9Q14BI7 1383 aa41,77■■■■■ 4,28
Homer3-202ENSMUST00000087467 Atp10aO54827 1508 aa41,74■■■■■ 4,27
Homer3-202ENSMUST00000087467 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa41,74■■■■■ 4,27
Homer3-202ENSMUST00000087467 NpatQ8BMA5 1420 aa41,71■■■■■ 4,27
Homer3-202ENSMUST00000087467 Dip2cE9PWR4 1557 aa41,71■■■■■ 4,27
Homer3-202ENSMUST00000087467 Kdm5cP41230 1554 aa41,7■■■■■ 4,27
Homer3-202ENSMUST00000087467 Abcc3B2RX12 1523 aa41,66■■■■■ 4,26
Homer3-202ENSMUST00000087467 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa41,66■■■■■ 4,26
Homer3-202ENSMUST00000087467 Cul9Q80TT8 1865 aa41,64■■■■■ 4,26
Homer3-202ENSMUST00000087467 RereQ80TZ9 1558 aa41,63■■■■■ 4,26
Homer3-202ENSMUST00000087467 Adcy10Q8C0T9 1614 aa41,62■■■■■ 4,25
Homer3-202ENSMUST00000087467 Cfap74Q3UY96 1578 aa41,61■■■■■ 4,25
Homer3-202ENSMUST00000087467 Neurl4Q5NCX5 1563 aa41,59■■■■■ 4,25
Homer3-202ENSMUST00000087467 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP41,59■■■■■ 4,25
Homer3-202ENSMUST00000087467 Caskin1Q6P9K8 1431 aa41,59■■■■■ 4,25
Homer3-202ENSMUST00000087467 Camsap2Q8C1B1 1461 aa41,57■■■■■ 4,25
Homer3-202ENSMUST00000087467 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP41,57■■■■■ 4,25
Homer3-202ENSMUST00000087467 Ccnb3Q810T2 1396 aa41,56■■■■■ 4,24
Homer3-202ENSMUST00000087467 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP41,56■■■■■ 4,24
Homer3-202ENSMUST00000087467 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP41,56■■■■■ 4,24
Homer3-202ENSMUST00000087467 MyclP10166 368 aa41,55■■■■■ 4,24
Homer3-202ENSMUST00000087467 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa41,52■■■■■ 4,24
Homer3-202ENSMUST00000087467 PtprmP28828 1452 aa41,52■■■■■ 4,24
Homer3-202ENSMUST00000087467 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa41,51■■■■■ 4,24
Homer3-202ENSMUST00000087467 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa41,49■■■■■ 4,23
Homer3-202ENSMUST00000087467 Cfap65Q3V0B4 1847 aa41,37■■■■■ 4,21
Homer3-202ENSMUST00000087467 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa41,35■■■■■ 4,21
Homer3-202ENSMUST00000087467 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP41,34■■■■■ 4,21
Homer3-202ENSMUST00000087467 Hecw1Q8K4P8 1604 aa41,29■■■■■ 4,2
Homer3-202ENSMUST00000087467 Map3k5O35099 1380 aa41,28■■■■■ 4,2
Homer3-202ENSMUST00000087467 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa41,24■■■■■ 4,19
Homer3-202ENSMUST00000087467 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP41,24■■■■■ 4,19
Homer3-202ENSMUST00000087467 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP41,22■■■■■ 4,19
Homer3-202ENSMUST00000087467 Afap1Q80YS6 731 aa41,21■■■■■ 4,19
Homer3-202ENSMUST00000087467 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa41,16■■■■■ 4,18
Homer3-202ENSMUST00000087467 Nos1Q9Z0J4 1429 aa41,14■■■■■ 4,18
Homer3-202ENSMUST00000087467 Talpid3E9PV87 1520 aa41,1■■■■■ 4,17
Homer3-202ENSMUST00000087467 SphkapQ6NSW3 1687 aa41,09■■■■■ 4,17
Homer3-202ENSMUST00000087467 Trpm1Q2TV84 1622 aa41,08■■■■■ 4,17
Homer3-202ENSMUST00000087467 Fhod3Q76LL6 1578 aa41,07■■■■■ 4,16
Homer3-202ENSMUST00000087467 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP41,06■■■■■ 4,16
Homer3-202ENSMUST00000087467 Myom2Q14BI5 1463 aa41,06■■■■■ 4,16
Homer3-202ENSMUST00000087467 Abca6Q8K441 1624 aa41,06■■■■■ 4,16
Homer3-202ENSMUST00000087467 Gli2Q0VGT2 1544 aa41,03■■■■■ 4,16
Homer3-202ENSMUST00000087467 Naip6Q9JIB6 1403 aa41,02■■■■■ 4,16
Homer3-202ENSMUST00000087467 Prdm16A2A935 1275 aa40,96■■■■■ 4,15
Homer3-202ENSMUST00000087467 Abcc5Q9R1X5 1436 aa40,94■■■■■ 4,14
Homer3-202ENSMUST00000087467 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa40,94■■■■■ 4,14
Homer3-202ENSMUST00000087467 Mtus2Q3UHD3 1353 aa40,93■■■■■ 4,14
Homer3-202ENSMUST00000087467 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP40,92■■■■■ 4,14
Homer3-202ENSMUST00000087467 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP40,9■■■■■ 4,14
Homer3-202ENSMUST00000087467 Trpm2Q91YD4 1506 aa40,88■■■■■ 4,14
Homer3-202ENSMUST00000087467 Kif3bQ61771 747 aa40,88■■■■■ 4,13
Homer3-202ENSMUST00000087467 Mast1Q9R1L5 1570 aa40,87■■■■■ 4,13
Homer3-202ENSMUST00000087467 Fmn2Q9JL04 1578 aa40,86■■■■■ 4,13
Homer3-202ENSMUST00000087467 Dip2bQ3UH60 1574 aa40,83■■■■■ 4,13
Homer3-202ENSMUST00000087467 Plekhh2Q8C115 1491 aa40,83■■■■■ 4,13
Homer3-202ENSMUST00000087467 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP40,82■■■■■ 4,12
Homer3-202ENSMUST00000087467 Cabp1Q9JLK7 227 aa40,77■■■■■ 4,12
Homer3-202ENSMUST00000087467 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa40,75■■■■■ 4,11
Homer3-202ENSMUST00000087467 Topaz1E5FYH1 1653 aa40,72■■■■■ 4,11
Homer3-202ENSMUST00000087467 RictorQ6QI06 1708 aa40,7■■■■■ 4,11
Homer3-202ENSMUST00000087467 Scn4aQ9ER60 1841 aa40,7■■■■■ 4,11
Homer3-202ENSMUST00000087467 Uggt2E9Q4X2 1504 aa40,69■■■■■ 4,1
Homer3-202ENSMUST00000087467 Dip2aQ8BWT5 1523 aa40,68■■■■■ 4,1
Homer3-202ENSMUST00000087467 Rsph4aQ8BYM7 716 aa40,68■■■■■ 4,1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,5 ms