RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adamts12Q811B3 1600 aa23.6■■□□□ 1.37
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chic2Q9D9G3 165 aa23.59■■□□□ 1.37
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgap27A2AB59 869 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ift140E9PY46 1464 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 A2mQ6GQT1 1474 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Soga1E1U8D0 1418 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 WrnO09053 1401 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Naip2Q9QUK4 1447 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccer2J3QPU5 274 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ncoa2Q61026 1462 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 BC005561E9Q5E2 1589 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca16E9PWJ7 1678 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NexmifQ5DTT1 1515 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Camsap2Q8C1B1 1461 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fhad1A6PWD2 1420 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mia2Q91ZV0 1396 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ube2uB1AUC4 352 aa23.43■■□□□ 1.34
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vps8Q0P5W1 1427 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ncoa3O09000 1398 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 P3h3Q8CG70 732 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abcc2Q8VI47 1543 aa23.41■■□□□ 1.34
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Iqcf3Q9D498 203 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kcnn1Q9EQR3 537 aa23.39■■□□□ 1.33
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc4a3P16283 1227 aa23.37■■□□□ 1.33
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 4933416C03RikQ3V063 378 aa23.37■■□□□ 1.33
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Shroom2A2ALU4 1481 aa23.35■■□□□ 1.33
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa23.35■■□□□ 1.33
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mug1P28665 1476 aa23.35■■□□□ 1.33
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mrs2Q5NCE8 434 aa23.34■■□□□ 1.33
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cabp1Q9JLK7 227 aa23.32■■□□□ 1.32
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Naip5Q9R016 1403 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gcc2Q8CHG3 1679 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 DaxxO35613 739 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp644E9QA22 1323 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abcc5Q9R1X5 1436 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgef11Q68FM7 1552 aa23.2■■□□□ 1.31
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rusc2Q80U22 1514 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm13695A2AK44 830 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pprc1Q6NZN1 1644 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mphosph9A6H5Y1 991 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kcnh8P59111 1102 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Neo1P97798 1493 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Exoc6Q8R313 802 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ChgaP26339 463 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pdcl3Q8BVF2 240 aa23.12■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plekhh2Q8C115 1491 aa23.12■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AknaQ80VW7 1404 aa23.12■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adcy10Q8C0T9 1614 aa23.12■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa23.12■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa23.11■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mroh2aD3Z750 1679 aa23.11■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Magi1Q6RHR9 1471 aa23.1■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Map3k4O08648 1597 aa23.09■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ncoa1P70365 1447 aa23.09■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prex2Q3LAC4 1598 aa23.08■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mtus2Q3UHD3 1353 aa23.08■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Jph4Q80WT0 628 aa23.08■■□□□ 1.29
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa23.07■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 L3mbtl2P59178 703 aa23.07■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SphkapQ6NSW3 1687 aa23.06■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NeflP08551 543 aa23.05■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rfx7F8VPJ6 1459 aa23.04■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa23.04■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cul7Q8VE73 1689 aa23.04■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tdrd9Q14BI7 1383 aa23.04■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AampJ3QN89 436 aa23.03■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ofd1Q80Z25 1017 aa23.02■■□□□ 1.28
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam163aQ8CAA5 168 aa23.01■■□□□ 1.27
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pkd2O35245 966 aa22.99■■□□□ 1.27
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fhod3Q76LL6 1578 aa22.99■■□□□ 1.27
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gtf2a1Q99PM3 378 aa22.98■■□□□ 1.27
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa22.98■■□□□ 1.27
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fgd6Q69ZL1 1399 aa22.97■■□□□ 1.27
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp777B9EKF4 885 aa22.96■■□□□ 1.27
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa22.96■■□□□ 1.27
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Il16O54824 1322 aa22.94■■□□□ 1.26
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