RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038356.12

Ube2q1-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2q1, Length 3,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ccnb3Q810T2 1396 aa30,07■■■□□ 2,4
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP30,06■■■□□ 2,4
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Vps8Q0P5W1 1427 aa30,06■■■□□ 2,4
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Chic2Q9D9G3 165 aa30,03■■■□□ 2,4
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Shroom2A2ALU4 1481 aa30,03■■■□□ 2,4
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP30,02■■■□□ 2,4
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 BC005561E9Q5E2 1589 aa29,97■■■□□ 2,39
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Washc2Q6PGL7 1334 aa29,96■■■□□ 2,39
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Naip2Q9QUK4 1447 aa29,96■■■□□ 2,39
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Neo1P97798 1493 aa29,95■■■□□ 2,38
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mrs2Q5NCE8 434 aa29,94■■■□□ 2,38
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa29,93■■■□□ 2,38
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Naip5Q9R016 1403 aa29,93■■■□□ 2,38
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ncoa2Q61026 1462 aa29,93■■■□□ 2,38
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 P3h3Q8CG70 732 aa29,92■■■□□ 2,38
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 NexmifQ5DTT1 1515 aa29,92■■■□□ 2,38
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ncoa3O09000 1398 aa29,91■■■□□ 2,38
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Camsap2Q8C1B1 1461 aa29,89■■■□□ 2,38
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Fgd6Q69ZL1 1399 aa29,88■■■□□ 2,37
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Jph4Q80WT0 628 aa29,87■■■□□ 2,37
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mug1P28665 1476 aa29,86■■■□□ 2,37
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa29,83■■■□□ 2,37
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 A2mQ6GQT1 1474 aa29,81■■■□□ 2,36
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa29,81■■■□□ 2,36
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa29,79■■■□□ 2,36
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 NrdcQ8BHG1 1161 aa29,78■■■□□ 2,36
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 PrkcshO08795 521 aa29,77■■■□□ 2,36
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP29,77■■■□□ 2,36
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pak3Q61036 559 aa29,77■■■□□ 2,36
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Map3k4O08648 1597 aa29,76■■■□□ 2,36
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP29,76■■■□□ 2,35
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa29,72■■■□□ 2,35
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa29,71■■■□□ 2,35
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Exoc6Q8R313 802 aa29,7■■■□□ 2,35
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cabp1Q9JLK7 227 aa29,7■■■□□ 2,35
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mphosph9A6H5Y1 991 aa29,69■■■□□ 2,34
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Arhgef11Q68FM7 1552 aa29,68■■■□□ 2,34
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Magi1Q6RHR9 1471 aa29,66■■■□□ 2,34
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Liat1Q810M6 228 aa29,65■■■□□ 2,34
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP29,65■■■□□ 2,34
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cul7Q8VE73 1689 aa29,64■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Slc4a3P16283 1227 aa29,63■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa29,62■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm13695A2AK44 830 aa29,62■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm14025A2AP89 1413 aa29,62■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pprc1Q6NZN1 1644 aa29,61■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa29,61■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP29,6■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Prex2Q3LAC4 1598 aa29,59■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mroh2aD3Z750 1679 aa29,59■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gcc2Q8CHG3 1679 aa29,59■■■□□ 2,33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ncoa1P70365 1447 aa29,56■■■□□ 2,32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Fam163aQ8CAA5 168 aa29,56■■■□□ 2,32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP29,55■■■□□ 2,32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Abcc5Q9R1X5 1436 aa29,53■■■□□ 2,32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Abcc1O35379 1528 aa29,53■■■□□ 2,32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Tdrd9Q14BI7 1383 aa29,52■■■□□ 2,32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mtus2Q3UHD3 1353 aa29,52■■■□□ 2,32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa29,51■■■□□ 2,32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Usp47Q8BY87 1376 aa29,51■■■□□ 2,31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Egfem1Q8C088 590 aa29,51■■■□□ 2,31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Plekhh2Q8C115 1491 aa29,5■■■□□ 2,31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa29,5■■■□□ 2,31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pkd2O35245 966 aa29,5■■■□□ 2,31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa29,48■■■□□ 2,31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Adcy10Q8C0T9 1614 aa29,48■■■□□ 2,31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zfp644E9QA22 1323 aa29,47■■■□□ 2,31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP29,46■■■□□ 2,31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ofd1Q80Z25 1017 aa29,43■■■□□ 2,3
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Fhod3Q76LL6 1578 aa29,42■■■□□ 2,3
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa29,41■■■□□ 2,3
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP29,4■■■□□ 2,3
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kcnh8P59111 1102 aa29,39■■■□□ 2,3
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Fancd2Q80V62 1450 aa29,39■■■□□ 2,3
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa29,38■■■□□ 2,29
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ccdc27Q3V036 639 aa29,36■■■□□ 2,29
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP29,33■■■□□ 2,29
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP29,32■■■□□ 2,28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP29,31■■■□□ 2,28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Chd1P40201 1711 aa29,31■■■□□ 2,28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Arid3cA6PWV5 409 aa29,3■■■□□ 2,28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 L3mbtl2P59178 703 aa29,29■■■□□ 2,28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP29,28■■■□□ 2,28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Setbp1Q9Z180 1582 aa29,27■■■□□ 2,28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ipo9Q91YE6 1041 aa29,26■■■□□ 2,28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa29,26■■■□□ 2,27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa29,25■■■□□ 2,27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rgl3Q3UYI5 709 aa29,25■■■□□ 2,27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP29,24■■■□□ 2,27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Arhgap5P97393 1501 aa29,22■■■□□ 2,27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 SphkapQ6NSW3 1687 aa29,22■■■□□ 2,27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rfx7F8VPJ6 1459 aa29,22■■■□□ 2,27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Il16O54824 1322 aa29,21■■■□□ 2,27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Znf608Q56A10 1511 aa29,2■■■□□ 2,27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP29,2■■■□□ 2,26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa29,2■■■□□ 2,26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP29,19■■■□□ 2,26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29,19■■■□□ 2,26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29,17■■■□□ 2,26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Trappc8E9PWG2 1437 aa29,17■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7,4 ms