RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	DSS1	P39112	969 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	FAA2	P39518	744 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	RTT105	P40063	208 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	TED1	P40533	473 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YGR210C	P42942	411 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	not detected
SOD1	YJR104C	UBX6	P47049	396 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ALT2	P52892	507 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	DAM1	P53267	343 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	CAF40	P53829	373 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	SIW14	P53965	281 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	UBX4	P54730	416 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	MRPL13	Q02204	264 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	RMI1	Q02685	241 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	RSC9	Q03124	581 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	RPN4	Q03465	531 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YMR010W	Q03687	405 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	DLT1	Q04216	342 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	GIS4	Q04233	774 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	RNH1	Q04740	348 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	SPC2	Q04969	178 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	PHM6	Q05637	104 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	COS7	Q07788	383 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	NTG2	Q08214	380 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	FEX2	Q08991	375 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	LDB17	Q12342	491 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	HRT3	Q12347	344 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	GTT2	Q12390	233 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	LAA1	P39526	2014 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YLR462W	O13556	202 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.48	□□□□□ -1.85	RIP-Chip
SOD1	YJR104C	GAL4	P04386	881 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	GAL3	P13045	520 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	TOP3	P13099	656 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	HEM15	P16622	393 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	VPS34	P22543	875 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	SNT1	P25357	1226 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	PGS1	P25578	521 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	AAD3	P25612	363 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	CWH43	P25618	953 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	PTC6	P25646	442 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	GPI10	P30777	616 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	LYP1	P32487	611 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	NUP2	P32499	720 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	PPG1	P32838	368 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	CSE2	P33308	149 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	DUT1	P33317	147 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	BAP2	P38084	609 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	DUG2	P38149	878 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	CDS1	P38221	457 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	POP7	P38291	140 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YHL049C	P38722	271 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	SBE22	P38814	852 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ERP2	P39704	215 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YEL075C	P39972	122 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YER189W	P40104	122 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	SOK1	P40317	901 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	MMM1	P41800	426 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YFL064C	P43540	174 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YFR018C	P43599	363 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	TYW3	P53177	273 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	SLG1	P54867	378 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ACS1	Q01574	713 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	REC102	Q02721	264 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ROD1	Q02805	837 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	SEG1	Q04279	960 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YLR352W	Q06479	807 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	YPL191C	Q08930	360 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ACM1	Q08981	209 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ERP4	Q12450	207 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	GAL1	P04385	528 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	GAL10	P04397	699 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOD1	YJR104C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		3.47	□□□□□ -1.85

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